More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1630 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  100 
 
 
397 aa  832    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  51.41 
 
 
396 aa  404  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  47.95 
 
 
410 aa  363  3e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  46.87 
 
 
401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1455  aldo/keto reductase  49.73 
 
 
399 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.981784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  46 
 
 
406 aa  355  1e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  45.37 
 
 
408 aa  350  2e-95  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  46 
 
 
400 aa  349  4e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  47.4 
 
 
400 aa  348  9e-95  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  44.97 
 
 
398 aa  348  1e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  45.65 
 
 
409 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  46.67 
 
 
409 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  44.11 
 
 
399 aa  342  8e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1665  aldo/keto reductase  46.4 
 
 
377 aa  340  2.9999999999999998e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1446  aldo/keto reductase  46.26 
 
 
383 aa  339  5e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00469922  normal  0.148441 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  45.79 
 
 
384 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  47.78 
 
 
377 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  44.84 
 
 
413 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  46.35 
 
 
382 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0276  aldo/keto reductase  43.61 
 
 
397 aa  325  6e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.874141  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2019  aldo/keto reductase  44.03 
 
 
380 aa  324  2e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0479916 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0529  aldo/keto reductase  44.56 
 
 
400 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.407453 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  43.49 
 
 
379 aa  319  7e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  44.13 
 
 
376 aa  316  5e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  42.97 
 
 
379 aa  316  5e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07500  aldo/keto reductase  44.14 
 
 
376 aa  314  1.9999999999999998e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  43.01 
 
 
379 aa  308  1.0000000000000001e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1653  aldo/keto reductase  44.18 
 
 
381 aa  305  6e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.953335 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  41.78 
 
 
381 aa  301  1e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0448  aldo/keto reductase  39.42 
 
 
374 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3061  aldo/keto reductase  39.15 
 
 
371 aa  265  8.999999999999999e-70  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000337761  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0769  Fe-S oxidoreductase  35.48 
 
 
379 aa  228  1e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000125779 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  35.33 
 
 
364 aa  220  3e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1057  aldo/keto reductase  36.68 
 
 
374 aa  213  4.9999999999999996e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000286681 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2587  aldo/keto reductase  36.02 
 
 
368 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000465282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  34.05 
 
 
370 aa  205  9e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1621  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
380 aa  203  4e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0222  aldo/keto reductase  33.69 
 
 
375 aa  199  7.999999999999999e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.782387  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0701  aldo/keto reductase  32.7 
 
 
368 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0135874  normal  0.0922669 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  36.18 
 
 
374 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  34.77 
 
 
376 aa  183  6e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  27.13 
 
 
386 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  28.16 
 
 
364 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  29.47 
 
 
337 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  27.68 
 
 
376 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  27.81 
 
 
376 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  25.47 
 
 
365 aa  120  6e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  26.82 
 
 
371 aa  118  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  27.67 
 
 
340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.7 
 
 
376 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  26.68 
 
 
374 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  26.42 
 
 
374 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0407  aldo/keto reductase  23.75 
 
 
383 aa  103  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  25.75 
 
 
350 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
343 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  23.86 
 
 
368 aa  101  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0602  oxidoreductase  26.28 
 
 
373 aa  97.8  3e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  25.46 
 
 
370 aa  97.8  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05031  aldo/keto reductase  25.15 
 
 
380 aa  97.8  3e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04651  aldo/keto reductase  25.36 
 
 
380 aa  95.5  1e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.205889  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1070  oxidoreductase aldo/keto reductase  24.94 
 
 
373 aa  94.4  3e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.587482  hitchhiker  0.00485834 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0440  aldo/keto reductase  24.63 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.102195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04961  aldo/keto reductase  24.7 
 
 
365 aa  91.7  2e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.583752  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1760  oxidoreductase  26.24 
 
 
373 aa  90.1  5e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06351  aldo/keto reductase family protein  24.68 
 
 
378 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.162815 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
351 aa  87  5e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04381  aldo/keto reductase  25.89 
 
 
378 aa  86.3  8e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  25 
 
 
370 aa  85.1  0.000000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  29.54 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17335  predicted protein  25.68 
 
 
455 aa  82.8  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0521  aldo/keto reductase  27.38 
 
 
294 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2442  aldo/keto reductase  28.12 
 
 
309 aa  81.6  0.00000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0272  aldo/keto reductase  21.61 
 
 
370 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4324  aldo/keto reductase  27.43 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  26.14 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  24.42 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0560  aldo/keto reductase  21.7 
 
 
402 aa  76.6  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  26.18 
 
 
302 aa  75.5  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1747  hypothetical protein  25.85 
 
 
394 aa  74.7  0.000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.482758  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1328  aldo/keto reductase  25.8 
 
 
408 aa  74.7  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0118769  normal  0.0186788 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  28.98 
 
 
347 aa  74.3  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1762  aldo/keto reductase  26.44 
 
 
350 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.384901  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
285 aa  74.3  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  25.83 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0202  aldo/keto reductase  24.33 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00470074 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2624  putative oxidoreductase  26.38 
 
 
347 aa  72.4  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.7862  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4128  aldo/keto reductase  26.48 
 
 
313 aa  72.8  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1186  aldo/keto reductase  28.76 
 
 
393 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.472263 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0564  aldo/keto reductase  25.73 
 
 
280 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1405  aldo/keto reductase  26.25 
 
 
326 aa  72  0.00000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.910985  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1081  aldo/keto reductase  33.77 
 
 
286 aa  71.6  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3895  aldo/keto reductase  29.34 
 
 
274 aa  72  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.216872  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0383  aldo/keto reductase  27.11 
 
 
351 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.639383  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  29.38 
 
 
283 aa  70.9  0.00000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1602  aldo/keto reductase  28.64 
 
 
281 aa  70.9  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4535  aldo/keto reductase  26.69 
 
 
394 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0927734  decreased coverage  0.00892549 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0206  aldo/keto reductase  24.04 
 
 
393 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5093  aldo/keto reductase  29.41 
 
 
326 aa  70.5  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.271262  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0550  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
343 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.216152  normal  0.992757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>