More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1483 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1483  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.260699  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4991  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.71 
 
 
615 aa  202  3e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1160  molybdenum ABC transporter, permease protein  50.72 
 
 
222 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311194  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1555  molybdenum ABC transporter, permease protein  51.67 
 
 
241 aa  201  8e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1738  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.37 
 
 
224 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.537538  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4148  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.06 
 
 
628 aa  198  3.9999999999999996e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.75217  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3044  molybdate ABC transporter inner membrane subunit  47.27 
 
 
602 aa  198  5e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.929745  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2230  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
604 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.064577  normal  0.730422 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2168  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  47.42 
 
 
604 aa  197  7.999999999999999e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0329  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  51.63 
 
 
226 aa  195  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0243  molybdate ABC transporter permease  47.53 
 
 
601 aa  195  5.000000000000001e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0275  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.42 
 
 
616 aa  190  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0342756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0199  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  45.5 
 
 
223 aa  185  4e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01610  molybdate ABC transporter, permease protein  45.45 
 
 
465 aa  182  4.0000000000000006e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3445  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  46.26 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0221  molybdenum ABC transporter, permease protein, putative  45.32 
 
 
224 aa  177  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0201  molybdenum ABC transporter permease  45.32 
 
 
229 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0220  molybdate ABC transporter, permease protein  45.32 
 
 
224 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0411  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.79 
 
 
227 aa  176  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.023234  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0185  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.83 
 
 
224 aa  176  3e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0227  molybdate ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0188  molybdenum ABC transporter, permease  44.83 
 
 
224 aa  176  4e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0192  molybdenum ABC transporter, permease  44.83 
 
 
224 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5100  molybdate ABC transporter, permease protein  43.84 
 
 
224 aa  175  4e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2197  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  48.61 
 
 
485 aa  175  5e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.103229  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4559  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.97 
 
 
230 aa  170  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000269219  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1442  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.19 
 
 
232 aa  170  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2345  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
223 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2303  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.45 
 
 
223 aa  167  9e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03860  molybdate ABC transporter, permease protein  46.23 
 
 
530 aa  167  1e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.552312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0570  molybdate ABC transporter permease  42.59 
 
 
238 aa  165  4e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1159  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.04 
 
 
224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000255894  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1578  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.65 
 
 
223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1532  molybdate ABC transporter permease  43.06 
 
 
221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.633851  normal  0.0430142 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3698  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.23 
 
 
226 aa  164  1.0000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2478  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.75 
 
 
235 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2227  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.44 
 
 
227 aa  162  3e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.262345  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0255  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.72 
 
 
229 aa  162  3e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.0859177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0230  molybdate porter  44.65 
 
 
233 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0169  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.55 
 
 
226 aa  161  6e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0633  molybdate ABC transporter permease  42.66 
 
 
238 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.977292  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4505  molybdate ABC transporter permease  42.01 
 
 
225 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0787443  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3859  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
225 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681466  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3668  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.01 
 
 
225 aa  158  5e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.487946 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2341  molybdate ABC transporter, permease protein  40.37 
 
 
218 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.302761  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2053  molybdate ABC transporter, permease protein  40.83 
 
 
218 aa  158  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1557  molybdate ABC transporter, permease protein  44.66 
 
 
225 aa  156  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.165088  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2237  molybdate ABC transporter inner membrane protein  41.55 
 
 
225 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18627  normal  0.176982 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1860  molybdenum ABC transporter, permease protein ModB  37.27 
 
 
223 aa  154  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2788  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.28 
 
 
233 aa  154  1e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2936  molybdate ABC transporter permease protein  39.01 
 
 
231 aa  153  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2849  molybdate ABC transporter permease protein  38.91 
 
 
231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1552  molybdate ABC transporter inner membrane protein  42.93 
 
 
222 aa  152  4e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.044111  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4332  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
228 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0615425  normal  0.0620289 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4222  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.98 
 
 
228 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368342  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2849  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
224 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1420  molybdate ABC transporter permease protein  39.01 
 
 
231 aa  150  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0244  molybdenum ABC transporter, permease protein  47.44 
 
 
171 aa  150  1e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0781  molybdate ABC transporter permease protein  39.01 
 
 
229 aa  150  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.205051  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4404  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.81 
 
 
224 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0844882  normal  0.161941 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0202  molybdenum ABC transporter permease  47.44 
 
 
176 aa  149  2e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2177  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.41 
 
 
226 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000048117 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2579  molybdenum ABC transporter, permease protein  43.2 
 
 
222 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3064  molybdate ABC transporter permease protein  38.57 
 
 
228 aa  149  4e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0650  NifC-like ABC-type porter  42.18 
 
 
270 aa  148  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0108436  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2881  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.21 
 
 
229 aa  148  7e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.471307  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6805  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
224 aa  147  9e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000182685 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1178  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.27 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1270  molybdate ABC transporter permease protein  37.56 
 
 
229 aa  146  3e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1208  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  39.81 
 
 
221 aa  145  6e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1580  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.44 
 
 
220 aa  144  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1454  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  40.78 
 
 
221 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0300  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  36 
 
 
274 aa  143  2e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4070  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  41.15 
 
 
227 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0747  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  44.31 
 
 
221 aa  140  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.831399  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4170  molybdate ABC transporter permease protein  36.61 
 
 
232 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.000814029  normal  0.102728 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05726  molybdate ABC transporter permease protein  37.79 
 
 
229 aa  139  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0377  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
221 aa  139  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1255  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  139  3e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1535  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.31 
 
 
221 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.368396  hitchhiker  0.0072763 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0703  molybdate ABC transporter permease  37.73 
 
 
230 aa  138  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3663  molybdate ABC transporter permease protein  40.49 
 
 
230 aa  138  6e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0909  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.268465  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0877  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.972003  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0818  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0846  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.349425  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0932  molybdate ABC transporter permease protein  41.63 
 
 
229 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.263026 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2108  ABC molybdenum transport system, permease subunit  41.85 
 
 
229 aa  137  8.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4203  molybdate ABC transporter permease protein  37.84 
 
 
233 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00994845  normal  0.868939 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1479  ABC molybdate transporter, inner membrane subunit  39.62 
 
 
224 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294519 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1797  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  42.44 
 
 
225 aa  137  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.561181  normal  0.0109558 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0459  molybdenum ABC transporter, permease protein  34.39 
 
 
225 aa  137  1e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0089  molybdate ABC transporter permease protein  38.68 
 
 
228 aa  136  2e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3864  molybdate ABC transporter permease protein  40.47 
 
 
245 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0083  molybdate ABC transporter permease protein  38.68 
 
 
228 aa  136  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.822842  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0829  molybdate ABC transporter permease protein  42.4 
 
 
240 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0480615  normal  0.653671 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0416  molybdate ABC transporter, inner membrane subunit  35.94 
 
 
226 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.473595  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1304  molybdate ABC transporter permease protein  38.57 
 
 
229 aa  135  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3879  molybdate ABC transporter permease protein  36.94 
 
 
233 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.227386  decreased coverage  0.00905915 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2469  molybdate ABC transporter permease protein  39.13 
 
 
233 aa  135  5e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0195657 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>