More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1050 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1050  aldo/keto reductase  100 
 
 
343 aa  715    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.780587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06340  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  57.77 
 
 
341 aa  419  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.964199  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1370  aldo/keto reductase family oxidoreductase  38.99 
 
 
350 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.778576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0465  aldo/keto reductase  35.63 
 
 
340 aa  218  1e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2291  aldo/keto reductase  37.05 
 
 
337 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000272492  hitchhiker  0.000000557849 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0236  aldo/keto reductase  29.89 
 
 
376 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.062444  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1483  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
285 aa  127  3e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000333106  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1522  aldo/keto reductase  36.14 
 
 
285 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2503  aldo/keto reductase  28.03 
 
 
374 aa  127  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4306  aldo/keto reductase  39.71 
 
 
332 aa  127  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1636  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
379 aa  116  5e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1570  aldo/keto reductase  27.44 
 
 
379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1658  aldo/keto reductase  26.52 
 
 
370 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000189792  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0625  aldo/keto reductase  28.72 
 
 
377 aa  107  4e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0356812  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2567  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
371 aa  105  8e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.17886  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0576  aldo/keto reductase  32.77 
 
 
351 aa  105  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1664  aldo/keto reductase  26.98 
 
 
370 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0687  aldo/keto reductase  31.82 
 
 
319 aa  102  7e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0288  aldo/keto reductase  29.14 
 
 
328 aa  102  9e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3654  aldo/keto reductase  28.96 
 
 
331 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.488784  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1210  aldo/keto reductase  31.32 
 
 
315 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.607792  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3350  aldo/keto reductase  27.93 
 
 
398 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.343434  normal  0.051891 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1414  aldo/keto reductase  27.79 
 
 
386 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2501  aldo/keto reductase  28.1 
 
 
316 aa  101  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0761  aldo/keto reductase  33 
 
 
283 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.273558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1630  aldo/keto reductase  27.65 
 
 
397 aa  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0288  aldo/keto reductase  28.78 
 
 
328 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.855792  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1286  aldo/keto reductase  28.37 
 
 
410 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0119891  decreased coverage  0.00591823 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2639  aldo/keto reductase  29.35 
 
 
400 aa  100  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.258498  normal  0.182592 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1237  aldo/keto reductase  28.85 
 
 
401 aa  100  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.496781  normal  0.0437747 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0684  aldo/keto reductase  28.73 
 
 
376 aa  100  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0695  aldo/keto reductase  28.81 
 
 
396 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.994792  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0745  aldo/keto reductase  28.3 
 
 
409 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0658  aldo/keto reductase  32.04 
 
 
288 aa  100  5e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1923  aldo/keto reductase  30.91 
 
 
312 aa  100  5e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.226373  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2764  aldo/keto reductase  26.29 
 
 
376 aa  99.8  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1718  aldo/keto reductase  27.76 
 
 
316 aa  99.4  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000512805 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0774  aldo/keto reductase  25.3 
 
 
315 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3250  aldo/keto reductase  28.05 
 
 
364 aa  99.4  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1226  aldo/keto reductase  28.53 
 
 
408 aa  98.6  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0763  aldo/keto reductase  27.5 
 
 
400 aa  98.2  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000804851 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1775  aldo/keto reductase  35.05 
 
 
314 aa  97.4  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1437  aldo/keto reductase  27.19 
 
 
316 aa  97.1  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0319  aldo/keto reductase  27.63 
 
 
381 aa  96.7  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.867242 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1727  aldo/keto reductase family oxidoreductase  26.59 
 
 
316 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.349394 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1920  aldo/keto reductase  29.96 
 
 
319 aa  96.3  8e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.770373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0964  aldo/keto reductase  28.93 
 
 
337 aa  95.9  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000631386  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0241  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
376 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.036795 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1623  aldo/keto reductase  27.09 
 
 
399 aa  94  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.34672  normal  0.190024 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0951  aldo/keto reductase  26.9 
 
 
406 aa  94.4  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1322  aldo/keto reductase  32.26 
 
 
324 aa  94.4  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3050  aldo/keto reductase  29.68 
 
 
319 aa  93.6  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0652752  normal  0.843265 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1335  aldo/keto reductase  31.55 
 
 
294 aa  94  4e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3100  aldo/keto reductase  36.57 
 
 
319 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.124867  normal  0.776601 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6576  aldo/keto reductase  27.6 
 
 
349 aa  93.2  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455998  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2293  aldo/keto reductase  31.88 
 
 
294 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.253278  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2200  aldo/keto reductase  33.91 
 
 
314 aa  92.8  8e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154507  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl252  putative aldo/keto reductase  31.48 
 
 
328 aa  92.8  8e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00286495  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3085  aldo/keto reductase  31.94 
 
 
311 aa  92.4  9e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.562577 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4508  aldo/keto reductase  32.38 
 
 
341 aa  92  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.532493  normal  0.56936 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1185  aldo/keto reductase  29.61 
 
 
319 aa  92  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0397337 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3304  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.18 
 
 
311 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236042 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3653  aldo/keto reductase  29.39 
 
 
347 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.233218  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1003  aldo/keto reductase  36.93 
 
 
319 aa  91.7  2e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.350642  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0504  aldo/keto reductase  25.47 
 
 
376 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.122684  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0667  aldo/keto reductase  31.48 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3927  aldo/keto reductase  33.18 
 
 
304 aa  91.7  2e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.185405  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2899  aldo/keto reductase  26.47 
 
 
374 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1705  aldo/keto reductase  29.52 
 
 
285 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.292927 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1283  aldo/keto reductase  33.89 
 
 
306 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2306  aldo/keto reductase  25.82 
 
 
365 aa  90.5  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2987  aldo/keto reductase  37.36 
 
 
319 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1210  aldo/keto reductase  26.86 
 
 
409 aa  90.5  4e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.97605  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5958  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
370 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3132  aldo/keto reductase  37.36 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6263  aldo/keto reductase  32.42 
 
 
351 aa  90.1  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1733  aldo/keto reductase family oxidoreductase  24.87 
 
 
382 aa  89.7  7e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.410484  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3786  aldo/keto reductase  31.9 
 
 
327 aa  89.7  7e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530664  normal  0.0153976 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2830  aldo/keto reductase  24.44 
 
 
379 aa  89.7  7e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0663366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2264  aldo/keto reductase  31.43 
 
 
306 aa  89.7  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0104  aldo/keto reductase  31.22 
 
 
294 aa  89.7  7e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0779  hypothetical protein  24.25 
 
 
368 aa  89.4  8e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  unclonable  0.000000000590838 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3197  aldo/keto reductase  26.42 
 
 
374 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000351042  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04990  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  27.04 
 
 
364 aa  89  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2005  oxidoreductase, aldo/keto reductase family  33.49 
 
 
311 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1451  aldo/keto reductase  25.4 
 
 
384 aa  89  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0899  aldo/keto reductase  29.55 
 
 
319 aa  89  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.666079  normal  0.29354 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1031  lolS protein  32.24 
 
 
304 aa  89  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1255  aldo/keto reductase  32.41 
 
 
327 aa  88.6  1e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1410  aldo/keto reductase  30.85 
 
 
285 aa  89  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00442876 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4005  lolS protein  31.78 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.149867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3838  aldo/keto reductase family oxidoreductase  31.78 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4318  oxidoreductase  31.78 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1924  aldo/keto reductase  26.82 
 
 
413 aa  88.2  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2110  aldo/keto reductase  24.57 
 
 
396 aa  87.8  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.797322  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4120  lolS protein  31.78 
 
 
304 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000109156 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1232  putative aldo/keto reductase  28.11 
 
 
316 aa  87.8  3e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16590  predicted oxidoreductase of aldo/keto reductase family  26.45 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.101314  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0914  aldo/keto reductase  23.71 
 
 
316 aa  87.4  3e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.288271  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6543  aldo/keto reductase  31.19 
 
 
351 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.204351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>