24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2168 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2168  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 68 aa  136  8.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.117298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0212  transcriptional regulator, XRE family  85.29 
 
 		 68 aa  120  7e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0249  XRE family transcriptional regulator  83.82 
 
 		 68 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0496  DNA-binding protein, putative  55.38 
 
 		 72 aa  78.6  0.00000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0857  transcriptional regulator, putative  56.25 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000197317 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0510  XRE family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 89 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152715  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6295  helix-turn-helix domain-containing protein  42.37 
 
 		 93 aa  54.3  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5678  XRE family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.669501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1196  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.151247 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3371  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 88 aa  47  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2161  helix-turn-helix domain-containing protein  39.66 
 
 		 126 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1776  transcriptional regulator, XRE family  44.64 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0912116  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2290  hypothetical protein  31.88 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2426  hypothetical protein  32.76 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5481  hypothetical protein  34.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5380  hypothetical protein  34.43 
 
 		 94 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2711  hypothetical protein  42.11 
 
 		 94 aa  43.9  0.0008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.75348 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0830  XRE family transcriptional regulator  40.35 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.0000289664  hitchhiker  0.0000066158 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2260  transcriptional regulator, XRE family  38.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0168  transcriptional regulator, XRE family  40.35 
 
 		 86 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0291  helix-turn-helix domain protein  39.66 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4821  hypothetical protein  32.79 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1529  transcriptional regulator, XRE family  39.34 
 
 		 139 aa  42  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.17746 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0155  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540606  hitchhiker  0.00139635 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>