More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1902 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1733  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  73.48 
 
 
469 aa  654    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000017319  normal  0.274178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1902  Phosphomannomutase  100 
 
 
473 aa  958    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0550466 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3809  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  62.4 
 
 
517 aa  611  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.249401  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00703  phosphomannomutase  50.32 
 
 
472 aa  463  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2889  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.57 
 
 
474 aa  448  1e-125  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4824  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  52.28 
 
 
499 aa  449  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.921542  normal  0.478129 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0769  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.32 
 
 
475 aa  443  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.934178  normal  0.109685 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3231  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  51.88 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0401358  normal  0.764695 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1061  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  49.48 
 
 
484 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.799252  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0943  phosphomannomutase, putative  49.48 
 
 
483 aa  431  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0774465  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1329  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  49.04 
 
 
472 aa  431  1e-119  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.117788  decreased coverage  0.000167775 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0348  phosphoglucomutase, putative  48.91 
 
 
477 aa  418  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.896466  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2309  putative phosphomannomutase  49.35 
 
 
477 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0454655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3790  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  48.54 
 
 
510 aa  421  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2262  phosphomannomutase  47.98 
 
 
478 aa  421  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0033572 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2311  putative phosphomannomutase  49.35 
 
 
477 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.016492 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2208  putative phosphomannomutase  49.35 
 
 
477 aa  420  1e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.11518  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2422  putative phosphomannomutase  49.14 
 
 
477 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00366334 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2716  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.77 
 
 
474 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.431398  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0540  putative phosphomannomutase  45.61 
 
 
467 aa  404  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2993  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  46.28 
 
 
474 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3242  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  45.05 
 
 
474 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0537  phosphomannomutase, putative  44.64 
 
 
445 aa  380  1e-104  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0126  phosphomannomutase  45.47 
 
 
481 aa  378  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1234  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  50.11 
 
 
469 aa  369  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.565449  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4097  hypothetical protein  49.02 
 
 
466 aa  363  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.909897  normal  0.207612 
 
 
-
 
NC_007489  RSP_4052  phosphoglucomutase/phosphomannomutase  49.24 
 
 
469 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4796  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  44.01 
 
 
499 aa  351  2e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4216  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.33 
 
 
465 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4238  mannose-6-phosphate isomerase, class I  39.17 
 
 
1553 aa  308  9e-83  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0224  phosphoglucosamine mutase  25.3 
 
 
449 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0230  phosphoglucosamine mutase  28.88 
 
 
459 aa  127  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.116009  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2115  phosphoglucosamine mutase  26.95 
 
 
448 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1723  phosphoglucosamine mutase  31.44 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.822287  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1783  phosphoglucosamine mutase  29.4 
 
 
450 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.363404  normal  0.362539 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0835  phosphoglucosamine mutase  29.87 
 
 
445 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0667  hypothetical protein  27.06 
 
 
419 aa  114  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1538  Phosphoglucosamine mutase  26.03 
 
 
450 aa  114  4.0000000000000004e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0505376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  25.26 
 
 
458 aa  114  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0154  phosphoglucosamine mutase  24.64 
 
 
449 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1566  phosphoglucosamine mutase  27.98 
 
 
455 aa  113  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2334  phosphoglucosamine mutase  28.38 
 
 
469 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.877927  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0158  phosphoglucosamine mutase  24.59 
 
 
448 aa  111  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.135407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0714  phosphomannomutase  26.88 
 
 
460 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.079186  normal  0.0391719 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1688  phosphoglucosamine mutase  28.63 
 
 
465 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0304007  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0059  phosphoglucosamine mutase  28.84 
 
 
450 aa  110  5e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2256  phosphoglucosamine mutase  27.75 
 
 
453 aa  110  6e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0360  phosphoglucosamine mutase  28.61 
 
 
483 aa  110  7.000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.943264  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1886  phosphoglucosamine mutase  28.75 
 
 
451 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000764387  hitchhiker  0.00000000296737 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2730  phosphoglucosamine mutase  28.46 
 
 
454 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1204  phosphoglucosamine mutase  24.69 
 
 
449 aa  108  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2635  phosphoglucosamine mutase  29.4 
 
 
454 aa  109  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0721  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  24.95 
 
 
452 aa  108  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0831033  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0496  Phosphoglucosamine mutase  28.76 
 
 
480 aa  108  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1384  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  28.42 
 
 
454 aa  108  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2839  phosphoglucosamine mutase  28.96 
 
 
453 aa  107  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1664  phosphoglucosamine mutase  27.91 
 
 
444 aa  107  5e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.194728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0486  Phosphoglucosamine mutase  28.78 
 
 
455 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0150  phosphoglucosamine mutase  25.26 
 
 
448 aa  107  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.250899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1805  phosphoglucosamine mutase  29.27 
 
 
451 aa  107  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.979092  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0187  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/alpha domain I  23.66 
 
 
439 aa  107  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.117639  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0504  phosphoglucosamine mutase  27.64 
 
 
430 aa  107  7e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.730223  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1599  phosphoglucosamine mutase  28.72 
 
 
454 aa  106  8e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1197  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  25.36 
 
 
453 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0464554 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1260  phosphoglucosamine mutase  27.86 
 
 
451 aa  105  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000461219  normal  0.0582076 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0949  phosphoglucosamine mutase  25.05 
 
 
447 aa  105  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0359  phosphoglucosamine mutase  25.83 
 
 
452 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2324  phosphoglucosamine mutase  26.56 
 
 
449 aa  106  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.4434  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0586  phosphoglucosamine mutase  25.88 
 
 
453 aa  105  1e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1163  phosphoglucosamine mutase  25 
 
 
449 aa  105  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2027  phosphoglucosamine mutase  27.14 
 
 
447 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1578  phosphoglucosamine mutase  28.49 
 
 
436 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.840977  normal  0.129452 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5135  phosphoglucosamine mutase  24.53 
 
 
448 aa  105  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0257  phosphoglucosamine mutase  29.35 
 
 
449 aa  105  2e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0497563  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2100  hypothetical protein  27.65 
 
 
450 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000873821  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_469  phosphomannomutase  27.19 
 
 
430 aa  105  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0189  phosphoglucosamine mutase  24.53 
 
 
448 aa  105  2e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.165004  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0528  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  27.12 
 
 
430 aa  104  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1001  phosphoglucosamine mutase  28.31 
 
 
460 aa  104  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00128114  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1517  phosphoglucosamine mutase  28.87 
 
 
450 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.862212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1019  phosphoglucosamine mutase  25.26 
 
 
447 aa  104  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2525  phosphoglucosamine mutase  27.39 
 
 
452 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.620742  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2634  phosphoglucosamine mutase  29.78 
 
 
454 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2260  phosphoglucosamine mutase  29.78 
 
 
454 aa  103  5e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0324957  hitchhiker  0.0000000138006 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0887  phosphoglucosamine mutase  25.8 
 
 
450 aa  103  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00143709  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1719  phosphoglucosamine mutase  26.93 
 
 
447 aa  103  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.905768 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0157  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0201  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0158  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0152  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0150  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.160931  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2021  phosphoglucomutase  25.26 
 
 
434 aa  102  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.63108 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0157  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2013  phosphoglucosamine mutase  29.02 
 
 
443 aa  103  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.993566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1095  phosphoglucosamine mutase  25.98 
 
 
489 aa  102  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.100565  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0151  phosphoglucosamine mutase  24.32 
 
 
448 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.205668  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0180  phosphoglucosamine mutase  24.84 
 
 
448 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2456  phosphoglucosamine mutase  28.1 
 
 
496 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.406799  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0721  phosphoglucosamine mutase  28.51 
 
 
446 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0545  phosphoglucosamine mutase  27.68 
 
 
447 aa  102  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>