More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0499 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  100 
 
 
296 aa  607  1e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  54.55 
 
 
291 aa  313  1.9999999999999998e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  52.43 
 
 
303 aa  310  2e-83  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0510  dihydropteroate synthase  55.32 
 
 
293 aa  301  1e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1985  dihydropteroate synthase  51.06 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  51.69 
 
 
291 aa  280  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1676  dihydropteroate synthase  49.83 
 
 
303 aa  275  7e-73  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  42.18 
 
 
311 aa  224  9e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  44.91 
 
 
400 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  43.9 
 
 
393 aa  219  5e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 
277 aa  214  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  42.25 
 
 
397 aa  214  9.999999999999999e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 
270 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  41.14 
 
 
302 aa  213  3.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  42.66 
 
 
279 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  42.71 
 
 
303 aa  211  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  44.2 
 
 
274 aa  211  2e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  43.51 
 
 
278 aa  210  2e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  42.27 
 
 
285 aa  209  6e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  40.69 
 
 
278 aa  209  6e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  42.37 
 
 
278 aa  208  1e-52  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2733  dihydropteroate synthase  47.69 
 
 
284 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0148953  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  42.52 
 
 
286 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  41.28 
 
 
287 aa  207  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  44.73 
 
 
413 aa  207  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  44.98 
 
 
258 aa  207  2e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  41.32 
 
 
376 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
282 aa  205  6e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  41.9 
 
 
290 aa  205  6e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
266 aa  205  7e-52  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
282 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  42.07 
 
 
259 aa  205  7e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
282 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  41.2 
 
 
282 aa  205  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  42.7 
 
 
277 aa  205  8e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0567  dihydropteroate synthase  40 
 
 
277 aa  204  1e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.194721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 
356 aa  204  2e-51  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
282 aa  204  2e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  39.26 
 
 
400 aa  203  3e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 
277 aa  203  3e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  39.72 
 
 
277 aa  202  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.72 
 
 
276 aa  202  4e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  40.49 
 
 
282 aa  203  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  39.44 
 
 
277 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  39.44 
 
 
277 aa  202  5e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  39.73 
 
 
282 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
282 aa  201  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  42.35 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0802  dihydropteroate synthase  40.49 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0102267  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  40.21 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  41.92 
 
 
394 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  41.99 
 
 
277 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  41.87 
 
 
286 aa  201  9.999999999999999e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  44.01 
 
 
278 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  37.27 
 
 
275 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  43.27 
 
 
331 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  40.85 
 
 
279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  42.29 
 
 
280 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.29 
 
 
280 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  42.29 
 
 
280 aa  200  3e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  42.29 
 
 
280 aa  200  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  41.99 
 
 
277 aa  200  3e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  42.29 
 
 
277 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  40.74 
 
 
283 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  41.64 
 
 
286 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  43.12 
 
 
278 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  41.88 
 
 
394 aa  199  5e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  42.96 
 
 
280 aa  199  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 
276 aa  199  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  41.05 
 
 
279 aa  199  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  40.4 
 
 
283 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0637  dihydropteroate synthase  37.93 
 
 
288 aa  199  6e-50  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  40.97 
 
 
283 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  41.02 
 
 
298 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  43.21 
 
 
396 aa  198  7.999999999999999e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  198  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  39.22 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
284 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  40.81 
 
 
286 aa  196  3e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  41.11 
 
 
291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  39.44 
 
 
397 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  195  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  39.79 
 
 
279 aa  195  8.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  40.29 
 
 
275 aa  194  1e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  41.28 
 
 
277 aa  194  1e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
280 aa  193  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.78 
 
 
277 aa  193  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  40.59 
 
 
286 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>