More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0510 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0510  dihydropteroate synthase  100 
 
 		 293 aa  589  1e-167  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0505  dihydropteroate synthase  61.19 
 
 		 303 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.183245  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1985  dihydropteroate synthase  60.07 
 
 		 301 aa  348  4e-95  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0420  dihydropteroate synthase  62.64 
 
 		 291 aa  338  5e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0615939  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0462  dihydropteroate synthase  59.23 
 
 		 291 aa  329  4e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0499  dihydropteroate synthase  55.32 
 
 		 296 aa  301  7.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.491755  normal  0.330866 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1676  dihydropteroate synthase  56.99 
 
 		 303 aa  297  1e-79  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0145  dihydropteroate synthase  43.99 
 
 		 311 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.392899  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  40.58 
 
 		 266 aa  219  3.9999999999999997e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  45.42 
 
 		 397 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0812  dihydropteroate synthase  40 
 
 		 270 aa  211  1e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000234542  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0072  dihydropteroate synthase  39.45 
 
 		 285 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2568  dihydropteroate synthase  44.29 
 
 		 286 aa  207  2e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.032898  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1098  dihydropteroate synthase  39.37 
 
 		 269 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0139197  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  43.22 
 
 		 280 aa  206  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1276  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 		 269 aa  204  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000186218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1882  dihydropteroate synthase  42.05 
 
 		 274 aa  203  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.747516  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  41.38 
 
 		 282 aa  203  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4496  dihydropteroate synthase  40.96 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.470248  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  43.1 
 
 		 278 aa  202  5e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  43.8 
 
 		 274 aa  202  6e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  42.91 
 
 		 279 aa  201  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1889  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 		 290 aa  201  9e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000220218  hitchhiker  0.00000000634632 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  37.46 
 
 		 400 aa  201  9.999999999999999e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 		 277 aa  201  9.999999999999999e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0067  dihydropteroate synthase  38.81 
 
 		 277 aa  200  3e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  42.01 
 
 		 394 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0111  dihydropteroate synthase  37.97 
 
 		 356 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3986  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 277 aa  198  7e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.000000000550562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 		 279 aa  198  9e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1122  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 		 284 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000916741  unclonable  0.00000000000396906 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0080  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000343414 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  38.63 
 
 		 278 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 277 aa  197  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 		 276 aa  198  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0070  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1029  dihydropteroate synthase  40.64 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.191608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0071  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0067  dihydropteroate synthase (DHPS) (dihydropteroate pyrophosphorylase)  39.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3423  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 277 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000169878  decreased coverage  0.000110965 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0071  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 280 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  44.33 
 
 		 298 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0083  dihydropteroate synthase  39.24 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.944677  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  40.91 
 
 		 277 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0995  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 		 279 aa  196  4.0000000000000005e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3289  dihydropteroate synthase  41.03 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3286  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000166046  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  42.76 
 
 		 280 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  37.91 
 
 		 278 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  45.45 
 
 		 413 aa  196  6e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0998  dihydropteroate synthase  44.13 
 
 		 306 aa  195  6e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000543452  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3497  dihydropteroate synthase  37.15 
 
 		 273 aa  195  7e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24342  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0067  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 286 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 277 aa  195  8.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5237  dihydropteroate synthase  39.58 
 
 		 277 aa  195  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000121132 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0069  dihydropteroate synthase  39.24 
 
 		 283 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3245  dihydropteroate synthase  40.91 
 
 		 277 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000109731  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  45.99 
 
 		 400 aa  194  1e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0079  dihydropteroate synthase  40.28 
 
 		 277 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.863078  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1716  dihydropteroate synthase  42.31 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.46526  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  41.7 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  42.16 
 
 		 277 aa  193  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  40.21 
 
 		 393 aa  193  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  41.32 
 
 		 272 aa  193  3e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  37.87 
 
 		 275 aa  193  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  37.15 
 
 		 283 aa  192  5e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 399 aa  192  6e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  41.55 
 
 		 279 aa  192  6e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  44.16 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  41.26 
 
 		 277 aa  191  1e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1596  dihydropteroate synthase  44.53 
 
 		 278 aa  190  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2638  dihydropteroate synthase  45.26 
 
 		 278 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.578756  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  41.61 
 
 		 278 aa  189  5e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  37.72 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 		 277 aa  189  5e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1808  dihydropteroate synthase  43.69 
 
 		 303 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.70358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  39.5 
 
 		 286 aa  189  5.999999999999999e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2317  dihydropteroate synthase  39.73 
 
 		 286 aa  188  8e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.052999  normal  0.0227117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 		 277 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03403  dihydropteroate synthase  39.16 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0223  dihydropteroate synthase  38.11 
 
 		 283 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000034848  normal  0.0279297 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  38.33 
 
 		 397 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002604  dihydropteroate synthase  39.03 
 
 		 259 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000406473  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  39.86 
 
 		 277 aa  186  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  40.36 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3045  dihydropteroate synthase  40.07 
 
 		 291 aa  187  3e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  39.93 
 
 		 282 aa  186  3e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4007  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0856154 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  39.71 
 
 		 277 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>