34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2036 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2036  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 109 aa  224  4e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.494843  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0397  transcriptional regulator, Fis family  87.88 
 
 		 110 aa  178  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0200714  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2388  transcriptional regulator, XRE family  76.42 
 
 		 106 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.673915  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0359  hypothetical protein  75 
 
 		 108 aa  160  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.114666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0295  transcriptional regulator-like  66.06 
 
 		 126 aa  142  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2046  transcriptional regulator, fis family  62.86 
 
 		 117 aa  142  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.03951  normal  0.243031 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1846  transcriptional regulator, fis family  67 
 
 		 109 aa  138  3e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2423  hypothetical protein  41.94 
 
 		 134 aa  75.9  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0429086 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2124  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1213  hypothetical protein  39.18 
 
 		 107 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.735424 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0484  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 116 aa  72.4  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0290  hypothetical protein  45.07 
 
 		 107 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1152  hypothetical protein  36.89 
 
 		 108 aa  67.4  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.168928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0262  hypothetical protein  43.24 
 
 		 107 aa  63.5  0.0000000009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.233822 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2048  hypothetical protein  34.74 
 
 		 119 aa  57  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000000000899924  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0176  hypothetical protein  48.15 
 
 		 119 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0533  hypothetical protein  36 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2449  Fis family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 105 aa  52.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0434  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 309 aa  52.8  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.463605  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2998  hypothetical protein  29.52 
 
 		 102 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2542  transcriptional regulator, XRE family  48.15 
 
 		 307 aa  53.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1410  transcriptional regulator-like protein  33.66 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000126907  hitchhiker  0.000639527 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2596  fis family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 114 aa  49.7  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1352  HTH DNA-binding protein  36.84 
 
 		 306 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.111494 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1910  conserved hypothetical protein  31.07 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2411  HTH DNA-binding protein  40.79 
 
 		 307 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0357343  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1314  hypothetical protein  43.33 
 
 		 231 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0237  hypothetical protein  40.98 
 
 		 237 aa  47.4  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.211231 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0204  hypothetical protein  53.33 
 
 		 230 aa  47  0.00008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.803129 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0770  hypothetical protein  47.83 
 
 		 234 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0496  hypothetical protein  70.37 
 
 		 77 aa  44.3  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0554271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2413  transcriptional regulator, XRE family  46.15 
 
 		 299 aa  43.1  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1469  Phosphomethylpyrimidine kinase  44.23 
 
 		 299 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0090  helix-turn-helix domain-containing protein  27.78 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.592947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>