16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0858 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0858  Fis family transcriptional regulator  100 
 
 		 298 aa  596  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.487763  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2162  transcriptional regulator, Fis family  45.87 
 
 		 298 aa  202  8e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.111868  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0746  TonB family protein  41.74 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000019388  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1909  hypothetical protein  36.96 
 
 		 314 aa  169  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0749  transcriptional regulator, Fis family  32.9 
 
 		 285 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0027337  normal  0.178173 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0613  TonB-like  35.55 
 
 		 286 aa  113  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.543734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1712  hypothetical protein  31.1 
 
 		 280 aa  107  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0852036  hitchhiker  0.00264543 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2211  TonB family protein  32.95 
 
 		 274 aa  57  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000585223  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0897  hypothetical protein  25.19 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000812436  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0754  TonB family protein  25.62 
 
 		 317 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.278027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2628  putative signal peptide protein  27.11 
 
 		 356 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0683  protein TolA  30.91 
 
 		 342 aa  43.5  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.907916  normal  0.730086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0587  TonB family protein  24.07 
 
 		 324 aa  43.5  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.018659  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  23.02 
 
 		 292 aa  42.7  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0727  protein TolA  31.15 
 
 		 342 aa  42.4  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00429068  normal  0.0892562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2225  TonB family protein  29.91 
 
 		 351 aa  42.4  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.109672  hitchhiker  0.000359894 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>