45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0595 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0595  metallophosphoesterase  100 
 
 		 288 aa  595  1e-169  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0723  metallophosphoesterase  57.64 
 
 		 291 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1861  metallophosphoesterase  54.51 
 
 		 288 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0744481  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1594  hypothetical protein  55.83 
 
 		 287 aa  353  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.351293 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1785  hypothetical protein  51.05 
 
 		 286 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0555  metallophosphoesterase  52.08 
 
 		 290 aa  321  9.999999999999999e-87  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.744788 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0616  metallophosphoesterase  50.52 
 
 		 286 aa  297  1e-79  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.875554  normal  0.440649 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2234  metallophosphoesterase  26.79 
 
 		 304 aa  73.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0912391  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2144  metallophosphoesterase  26.47 
 
 		 268 aa  63.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0336658  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1705  metallophosphoesterase  25.1 
 
 		 268 aa  62.4  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3063  metallophosphoesterase  24.43 
 
 		 307 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.312394 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4889  metallophosphoesterase  25.3 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.402966  normal  0.967769 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1012  Ser/Thr protein phosphatase family protein  23.46 
 
 		 294 aa  50.4  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.329286  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4425  metallophosphoesterase  25.3 
 
 		 292 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.124915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4935  metallophosphoesterase  25.2 
 
 		 294 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.13002  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2100  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 223 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0873153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3391  metallophosphoesterase  23.32 
 
 		 363 aa  45.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.119138  normal  0.040425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4158  metallophosphoesterase  22.55 
 
 		 364 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2283  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 300 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.802251  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2506  exonuclease subunit SbcD  31.48 
 
 		 423 aa  44.3  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.947885  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0317  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.639541  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3211  nuclease SbcCD, D subunit  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.13705  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0473  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.332797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00350  hypothetical protein  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3235  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.294623  hitchhiker  0.00000199407 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0425  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0466  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.890943  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00346  exonuclease, dsDNA, ATP-dependent  31.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4196  metallophosphoesterase  22.43 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.600971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1302  exonuclease subunit SbcD  28.42 
 
 		 408 aa  43.9  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.315565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4050  metallophosphoesterase  22.46 
 
 		 292 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.163562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2972  metallophosphoesterase  22.94 
 
 		 331 aa  43.5  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.992281 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0427  exonuclease subunit SbcD  31.58 
 
 		 400 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.429993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3198  metallophosphoesterase  22.94 
 
 		 315 aa  43.5  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1681  metallophosphoesterase  26.89 
 
 		 307 aa  43.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.162395  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0629  metallophosphoesterase  29.41 
 
 		 274 aa  43.1  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0433  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 400 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2701  exodeoxyribonuclease I subunit D  28.78 
 
 		 386 aa  42.7  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.0000616496  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0434  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 400 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.60373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0452  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 400 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0439  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 400 aa  42.7  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.196846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2800  metallophosphoesterase  23.68 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.223154  normal  0.033229 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0494  exonuclease subunit SbcD  32.63 
 
 		 400 aa  42.4  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.413766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1382  metallophosphoesterase  22.3 
 
 		 298 aa  42  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.555745 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0843  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 274 aa  42.4  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>