22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_2122 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_2122  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  396  9.999999999999999e-111  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000123592  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5569  hypothetical protein  33.33 
 
 
201 aa  107  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.021029  normal  0.152515 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2035  hypothetical protein  34.34 
 
 
205 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.911552  normal  0.453545 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11983  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  75.1  0.0000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5218  hypothetical protein  30.49 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0127  hypothetical protein  29.08 
 
 
186 aa  67.8  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0844829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4185  hypothetical protein  26.55 
 
 
214 aa  62.8  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.279246 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3557  hypothetical protein  32.79 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0021439  normal  0.145009 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0125  hypothetical protein  31.07 
 
 
194 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177537  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11903  hypothetical protein  25.84 
 
 
188 aa  56.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.537015  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4195  hypothetical protein  26 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0939  hypothetical protein  29.79 
 
 
233 aa  52.8  0.000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000126087  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0924  hypothetical protein  29.33 
 
 
194 aa  48.5  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0250313 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6432  hypothetical protein  29.11 
 
 
199 aa  48.5  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.693573  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0752  hypothetical protein  25.32 
 
 
214 aa  48.5  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.718859  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3284  hypothetical protein  30.34 
 
 
195 aa  47.4  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.268547 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2118  hypothetical protein  27.2 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.00000000530474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2485  hypothetical protein  23.35 
 
 
213 aa  45.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2314  hypothetical protein  26.23 
 
 
214 aa  46.2  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.329476  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0675  hypothetical protein  25.54 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2635  hypothetical protein  24.02 
 
 
223 aa  43.1  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.788898  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1083  hypothetical protein  27.42 
 
 
200 aa  42.7  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>