73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_1087 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
296 aa  606  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  66.44 
 
 
298 aa  395  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  67.8 
 
 
295 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
296 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  64.41 
 
 
296 aa  383  1e-105  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.16 
 
 
293 aa  376  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.48 
 
 
297 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.48 
 
 
297 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.46 
 
 
299 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  63.48 
 
 
297 aa  374  1e-103  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.71 
 
 
296 aa  370  1e-101  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  62.5 
 
 
294 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.22 
 
 
306 aa  364  1e-100  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  61.67 
 
 
300 aa  362  5.0000000000000005e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.45 
 
 
299 aa  354  8.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.25 
 
 
296 aa  352  5e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.04 
 
 
299 aa  345  7e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.32 
 
 
300 aa  343  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.97 
 
 
295 aa  341  9e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 
294 aa  339  2.9999999999999998e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  59.22 
 
 
299 aa  338  7e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.53 
 
 
298 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.68 
 
 
321 aa  335  7e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.22 
 
 
296 aa  333  1e-90  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.61 
 
 
296 aa  333  3e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.14 
 
 
296 aa  328  5.0000000000000004e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.48 
 
 
296 aa  327  1.0000000000000001e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.4 
 
 
298 aa  323  3e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.95 
 
 
301 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.55 
 
 
298 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.14 
 
 
296 aa  297  1e-79  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  30.51 
 
 
343 aa  67  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  27.16 
 
 
335 aa  60.8  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  34.44 
 
 
336 aa  60.8  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0565  fructose-bisphosphate aldolase  28.81 
 
 
340 aa  55.8  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33820  predicted protein  28.27 
 
 
337 aa  55.8  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  31.28 
 
 
341 aa  55.5  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  31.47 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  32.07 
 
 
334 aa  54.7  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  29.18 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.76 
 
 
355 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  29.55 
 
 
339 aa  53.9  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  28.37 
 
 
355 aa  51.6  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  27.27 
 
 
348 aa  52  0.00001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.7 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  28.88 
 
 
355 aa  51.2  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  29.82 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  29.82 
 
 
334 aa  51.6  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  29.28 
 
 
341 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1334  fructose-bisphosphate aldolase  28.26 
 
 
339 aa  49.7  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0119283 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  29.38 
 
 
334 aa  49.7  0.00006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2737  fructose-bisphosphate aldolase, class-I  28.65 
 
 
343 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.349178  normal  0.970752 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3436  fructose-bisphosphate aldolase  28.95 
 
 
341 aa  49.3  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.127219  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  27.37 
 
 
336 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  26.42 
 
 
401 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  27.37 
 
 
336 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4773  fructose-bisphosphate aldolase  28.8 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.762754  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3077  fructose-bisphosphate aldolase  28.18 
 
 
341 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.918976  normal  0.730291 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  28.06 
 
 
359 aa  47  0.0004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1003  fructose-bisphosphate aldolase  27.93 
 
 
339 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.366961  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2993  Fructose-bisphosphate aldolase  27.68 
 
 
343 aa  46.2  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  27.53 
 
 
343 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  25.57 
 
 
344 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  27.62 
 
 
341 aa  44.3  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4471  fructose-bisphosphate aldolase  27.01 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1185  fructose-bisphosphate aldolase  28.49 
 
 
341 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  27.81 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0141  fructose-bisphosphate aldolase, class I  30.27 
 
 
342 aa  44.3  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  29.78 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0177  Fructose-bisphosphate aldolase  29.63 
 
 
327 aa  43.5  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0152366  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  27.59 
 
 
342 aa  43.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1070  Fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
344 aa  43.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>