13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0253 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0253  secreted protein containing glycosyl hydrolase BNR repeats  100 
 
 		 348 aa  724    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0299719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4778  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  37.58 
 
 		 360 aa  241  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.937851  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10298  putative oxidoreductase  35.91 
 
 		 344 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.263236  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6617  oxidoreductase, putative  29.41 
 
 		 341 aa  146  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3100  oxidoreductase  32.22 
 
 		 353 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68951  normal  0.106806 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3373  oxidoreductase  31.06 
 
 		 372 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4958  hypothetical protein  29.44 
 
 		 357 aa  107  3e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.75067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2202  glycosyl hydrolase  34.36 
 
 		 351 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.120875  normal  0.984431 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24590  uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  25.93 
 
 		 352 aa  92.8  7e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0295  oxidoreductase  33.83 
 
 		 347 aa  92  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.171806 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3920  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  25.8 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2022  hypothetical protein  23.02 
 
 		 897 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3319  Uncharacterized photosystem II stability/assembly factor-like protein  29.7 
 
 		 1120 aa  44.3  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>