16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1657 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1657  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 258 aa  498  1e-140  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0203159  decreased coverage  0.000243184 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1474  ABC-2 type transporter  26.7 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0887  ABC transporter, permease protein  25.45 
 
 		 243 aa  52.4  0.000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00136851  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0462  nodulation protein J  26.32 
 
 		 268 aa  50.4  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.266154  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1399  ABC-2 type transporter  24.32 
 
 		 278 aa  48.9  0.00007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0902  ABC-2 type transporter  27.75 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4308  hypothetical protein  30.41 
 
 		 260 aa  47  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.318258 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1137  ABC-2 type transporter  26.17 
 
 		 260 aa  45.8  0.0007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.18489  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0185  ABC-2 type transporter  27.13 
 
 		 265 aa  45.1  0.001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.361684  normal  0.861322 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1889  ABC-2 type transporter  24.88 
 
 		 413 aa  43.9  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.387622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3320  ABC-2 type transporter  26 
 
 		 269 aa  44.3  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  27.34 
 
 		 254 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1398  ABC-2 type transporter  22.28 
 
 		 278 aa  43.9  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.541771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3952  ABC-2 type transporter  23.36 
 
 		 268 aa  43.1  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106214  normal  0.0583359 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1654  hypothetical protein  29.41 
 
 		 261 aa  42.7  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2464  ABC-2 type transporter  31.67 
 
 		 286 aa  42.4  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114145  normal  0.499029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>