18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1566 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 104 aa  211  1.9999999999999998e-54  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  64 
 
 		 105 aa  136  1e-31  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  55.1  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 111 aa  53.9  0.0000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 141 aa  53.5  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  37.89 
 
 		 112 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  35.8 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  42.71 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 113 aa  48.9  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  31.52 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  37.14 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  32.61 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  34.44 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 121 aa  44.3  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  25.71 
 
 		 109 aa  43.9  0.0007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  35.53 
 
 		 147 aa  41.6  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  30.19 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>