16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0050 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0050  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  580  1e-164  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.417141  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0247  protein-disulfide isomerase-like protein  39.06 
 
 
217 aa  54.3  0.000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.325899 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0545  DSBA oxidoreductase  33.8 
 
 
269 aa  47  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.134926  normal  0.557973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1093  hypothetical protein  36.54 
 
 
227 aa  46.2  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.317381  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1055  hypothetical protein  27.45 
 
 
234 aa  45.4  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0635294  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0700  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 
243 aa  45.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.770375  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1670  DSBA oxidoreductase  39.13 
 
 
240 aa  45.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1712  hypothetical protein  30.43 
 
 
208 aa  43.9  0.003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.328153  normal  0.11413 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1181  DSBA oxidoreductase  40.35 
 
 
265 aa  44.3  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1658  DSBA oxidoreductase  26.32 
 
 
263 aa  43.9  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0065  DSBA oxidoreductase  43.1 
 
 
205 aa  43.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0319526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3616  DSBA oxidoreductase  32.76 
 
 
293 aa  43.1  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.1673  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0493  hypothetical protein  36.84 
 
 
205 aa  42.7  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1644  DSBA oxidoreductase  36.92 
 
 
262 aa  42.7  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3717  DSBA oxidoreductase  38.18 
 
 
268 aa  42.7  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00521015 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0519  DSBA oxidoreductase  35.71 
 
 
251 aa  42.4  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.507286  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>