26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1931 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1931  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  629  1e-179  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0508  hypothetical protein  81.64 
 
 		 312 aa  521  1e-147  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.647298  normal  0.0833781 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0787  hypothetical protein  80.66 
 
 		 312 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.251982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0654  hypothetical protein  80.33 
 
 		 312 aa  511  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.163272  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1303  hypothetical protein  55.59 
 
 		 300 aa  341  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.138879  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3139  hypothetical protein  51.82 
 
 		 305 aa  321  9.000000000000001e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6554  hypothetical protein  46.96 
 
 		 281 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0145506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01415  hypothetical protein  40.26 
 
 		 307 aa  219  6e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.134141  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5454  hypothetical protein  42.35 
 
 		 289 aa  219  6e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.806789  normal  0.501577 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3270  hypothetical protein  41.36 
 
 		 303 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6339  hypothetical protein  41.99 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2054  hypothetical protein  36.16 
 
 		 310 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.627069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4573  hypothetical protein  39.22 
 
 		 293 aa  185  9e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0767452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0082  hypothetical protein  37.26 
 
 		 281 aa  168  8e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0911  hypothetical protein  35.62 
 
 		 300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.34254  normal  0.442547 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5649  hypothetical protein  37.72 
 
 		 230 aa  155  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00621516  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2876  hypothetical protein  32.62 
 
 		 287 aa  134  9.999999999999999e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4516  hypothetical protein  31.7 
 
 		 283 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0680  hypothetical protein  29.61 
 
 		 278 aa  110  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1285  abortive infection protein AbiGII  33.49 
 
 		 281 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5578  hypothetical protein  27.24 
 
 		 303 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0557  hypothetical protein  26.98 
 
 		 285 aa  92.8  7e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000428757 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11069  hypothetical protein  29.25 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.204604 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1070  hypothetical protein  27.39 
 
 		 299 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3282  hypothetical protein  24.91 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5472  hypothetical protein  22.61 
 
 		 339 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590997  normal  0.790383 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>