63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1456 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  79.73 
 
 		 520 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  79.73 
 
 		 520 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1456  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 522 aa  1092    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  79.73 
 
 		 520 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0240  transposase IS4 family protein  99.81 
 
 		 522 aa  1090    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  79.73 
 
 		 520 aa  894    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  35.37 
 
 		 536 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  28.54 
 
 		 530 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1041  transposase IS4 family protein  24.48 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0885  hypothetical protein  24.63 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0267734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0277  transposase IS4 family protein  24.63 
 
 		 570 aa  145  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000194582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1290  transposase, IS4 family protein  71.23 
 
 		 84 aa  119  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.42125  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1559  transposase IS4 family protein  23.05 
 
 		 555 aa  68.2  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1199  transposase IS4 family protein  22.24 
 
 		 540 aa  65.9  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3569  transposase IS4 family protein  22.6 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3173  transposase IS4 family protein  25.16 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.418801 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2668  transposase IS4 family protein  25.16 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.641084  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1144  transposase IS4 family protein  25.16 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.923629  normal  0.0203233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1109  transposase IS4 family protein  25.16 
 
 		 538 aa  64.3  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.659688 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0336  transposase IS4 family protein  22.24 
 
 		 540 aa  64.3  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0523  Transposase-like protein  22.27 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.227256 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1823  Transposase-like protein  22.27 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.615645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3710  Transposase-like protein  22.27 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3301  Transposase-like protein  22.27 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2500  Transposase-like protein  22.27 
 
 		 586 aa  62.4  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.950355  normal  0.049375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3755  transposase, IS4 family protein  23.97 
 
 		 566 aa  59.3  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  21.84 
 
 		 561 aa  57  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3379  transposase, IS4 family protein  21.38 
 
 		 559 aa  54.3  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0558  transposase  25.11 
 
 		 449 aa  52.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  21.21 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  21.21 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3202  transposase, IS4 family protein  21.99 
 
 		 414 aa  52  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  21.21 
 
 		 548 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3223  transposase, IS4 family protein  22.25 
 
 		 548 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.505211  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3161  transposase, IS4 family protein  22.25 
 
 		 547 aa  51.2  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.922014  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3055  transposase IS4 family protein  20.87 
 
 		 596 aa  50.8  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3614  transposase  28.47 
 
 		 359 aa  50.4  0.00007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1239  transposase IS4 family protein  20.87 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0279  transposase IS4 family protein  20.87 
 
 		 596 aa  50.1  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1460  hypothetical protein  23.16 
 
 		 642 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2970  transposase, IS4 family protein  20.34 
 
 		 594 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.210297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2645  transposase IS4 family protein  21.89 
 
 		 522 aa  48.1  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3900  transposase IS4 family protein  22.46 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.44467 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2943  transposase IS4 family protein  22.46 
 
 		 587 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1854  transposase IS1634 family protein  20.41 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1448  transposase IS1634 family protein  20.41 
 
 		 532 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0236  transposase IS4 family protein  23.67 
 
 		 596 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.235641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  24.71 
 
 		 558 aa  46.6  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0517  transposase IS4 family protein  25.15 
 
 		 558 aa  45.8  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0129  transposase, IS4 family protein  21.99 
 
 		 562 aa  45.4  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4459  transposase IS1634 family protein  21.31 
 
 		 526 aa  44.7  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0721  transposase  22.59 
 
 		 578 aa  44.3  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0383  transposase IS4 family protein  20.06 
 
 		 604 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1821  hypothetical protein  25 
 
 		 260 aa  43.9  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1759  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.518431  normal  0.0966582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1526  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000549576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0053  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000750234  normal  0.48496 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0355  transposase  20.63 
 
 		 545 aa  43.5  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3637  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2508  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0152429  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2452  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000508374  normal  0.561674 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2203  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477552  normal  0.262943 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1981  transposase, IS4 family protein  24.09 
 
 		 632 aa  43.5  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>