18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1041 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1041  transposase IS4 family protein  100 
 
 		 570 aa  1183    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00324527  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0885  hypothetical protein  99.47 
 
 		 570 aa  1178    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0267734  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0277  transposase IS4 family protein  99.65 
 
 		 570 aa  1180    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000194582  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1523  transposase, IS4  25.51 
 
 		 536 aa  178  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.833307  normal  0.230483 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0161  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1050  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1562  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2142  transposase IS4 family protein  24.49 
 
 		 520 aa  153  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0240  transposase IS4 family protein  24.69 
 
 		 522 aa  147  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.995289  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1456  transposase IS4 family protein  24.48 
 
 		 522 aa  145  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0852  hypothetical protein  75.64 
 
 		 82 aa  122  9.999999999999999e-27  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0717088  normal  0.75194 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0262  transposase, IS4  21.06 
 
 		 530 aa  86.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.952811  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3892  transposase IS4 family protein  23.41 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3060  transposase IS4 family protein  24.13 
 
 		 579 aa  47.8  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1552  transposase IS4 family protein  24.66 
 
 		 558 aa  47.4  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3830  hypothetical protein  21.73 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.364785 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3741  hypothetical protein  21.73 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1430  transposase, IS4 family protein  21.73 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>