More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0428 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0428  xanthine/uracil permease family protein  100 
 
 		 440 aa  863    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1372  xanthine/uracil permease family protein  68.97 
 
 		 439 aa  613  9.999999999999999e-175  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0281  xanthine/uracil permease family protein  68.28 
 
 		 439 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1561  xanthine/uracil permease family protein  68.05 
 
 		 439 aa  598  1e-170  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1484  inner membrane protein YicO  59.95 
 
 		 430 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1685  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.18 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0583  xanthine/uracil permease family protein  56.42 
 
 		 443 aa  496  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.628445  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0221  inner membrane protein YicO  57.66 
 
 		 443 aa  493  9.999999999999999e-139  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0399  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.84 
 
 		 428 aa  474  1e-132  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0661  uracil-xanthine permease, putative  42.33 
 
 		 430 aa  322  6e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.515071  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0623  putative uracil-xanthine permease  44.23 
 
 		 430 aa  322  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3892  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.82 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.642873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3780  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.82 
 
 		 434 aa  319  5e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0612559  normal  0.111868 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3768  xanthine/uracil/vitamin C permease  43 
 
 		 430 aa  318  7.999999999999999e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  42.56 
 
 		 437 aa  312  9e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02237  hypothetical protein  39.41 
 
 		 434 aa  312  9e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.153776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0832  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.92 
 
 		 430 aa  310  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4648  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.49 
 
 		 431 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4615  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.79 
 
 		 430 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177747  normal  0.424997 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4653  xanthine/uracil/vitamin C permease  42 
 
 		 431 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0785  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.49 
 
 		 431 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4515  xanthine/uracil/vitamin C permease  42 
 
 		 441 aa  306  7e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.777214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.53 
 
 		 429 aa  305  9.000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.03 
 
 		 431 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4286  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.19892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62440  putative transporter  41.55 
 
 		 431 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4653  xanthine/uracil permease family protein  39.95 
 
 		 431 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1716  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.83 
 
 		 433 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.373341  normal  0.633993 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5435  putative transporter  41.12 
 
 		 431 aa  302  6.000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0195  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.58 
 
 		 433 aa  303  6.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.682246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.02 
 
 		 442 aa  302  9e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.91 
 
 		 440 aa  301  1e-80  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0887  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.09 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.45 
 
 		 441 aa  299  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.24 
 
 		 453 aa  299  5e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3796  xanthine/uracil/vitamin C permease  41.44 
 
 		 454 aa  299  5e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0566594 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1571  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.35 
 
 		 433 aa  299  6e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3579  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.12 
 
 		 431 aa  298  1e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.429295  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3600  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.82 
 
 		 429 aa  297  2e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5815  putative xanthine/uracil permease  40.35 
 
 		 453 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  39.18 
 
 		 445 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3086  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.3 
 
 		 429 aa  294  2e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  38.94 
 
 		 445 aa  293  4e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  38.94 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  38.94 
 
 		 445 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3644  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.84 
 
 		 433 aa  292  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0702  xanthine/uracil/vitamin C transporter  40.84 
 
 		 433 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.88 
 
 		 443 aa  292  8e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.55 
 
 		 446 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4161  AzgA family purine transporter  39.61 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.241199  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4915  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.35 
 
 		 433 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.82 
 
 		 460 aa  290  3e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4187  AzgA family purine transporter  39.37 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.13379  normal  0.0103225 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.37 
 
 		 442 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2517  xanthine/uracil permease family protein  38.07 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000472895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1814  permease  39.23 
 
 		 433 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5908  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.05 
 
 		 432 aa  289  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.688151  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1120  xanthine/uracil permease family protein  37.73 
 
 		 429 aa  289  7e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4396  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.35 
 
 		 433 aa  289  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.323664  normal  0.0500816 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2849  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.1 
 
 		 429 aa  289  8e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.279193  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1785  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.5 
 
 		 436 aa  289  8e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.31517e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2813  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.64 
 
 		 432 aa  289  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4217  Xanthine/uracil/vitamin C permease  41.63 
 
 		 445 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1012  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.9 
 
 		 429 aa  288  1e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3392  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5312  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0101725  normal  0.154403 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4975  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.59 
 
 		 433 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0900295  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.53 
 
 		 429 aa  287  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0911  xanthine/uracil permease family protein  40.74 
 
 		 433 aa  287  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2977  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.55 
 
 		 429 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0039  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0035  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 444 aa  286  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  37.99 
 
 		 470 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  37.99 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  37.99 
 
 		 444 aa  286  5e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3877  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.99 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0817  xanthine/uracil permease family protein  40.51 
 
 		 433 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.93 
 
 		 470 aa  286  5e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1036  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0168268 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3543  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.630189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.99 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4081  sulfate permease family inorganic anion transporter  38.39 
 
 		 445 aa  286  5e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.578449 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3325  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 429 aa  286  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  37.93 
 
 		 448 aa  286  5.999999999999999e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0021  xanthine/uracil/vitamin C permease  39.76 
 
 		 445 aa  286  5.999999999999999e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.395104 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0953  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.18 
 
 		 429 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2793  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.52 
 
 		 431 aa  286  7e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0631  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.51 
 
 		 433 aa  285  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000126006  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5121  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.86 
 
 		 433 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.560875  normal  0.502437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0951  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.95 
 
 		 429 aa  285  8e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000025373  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0823  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8721299999999997e-52 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0804  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.192586  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0711  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000785311  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0662  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0654  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000000506416  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5339  xanthine/uracil/vitamin C permease:sulphate transporter  38.74 
 
 		 453 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0747  xanthine/uracil permease family protein  40.28 
 
 		 433 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.237802  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0989  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.73 
 
 		 429 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0100003  normal  0.443462 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4280  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.16 
 
 		 445 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>