16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_3486 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_3486  hypothetical protein  100 
 
 
604 aa  1121    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  39.02 
 
 
857 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  43.11 
 
 
493 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.15 
 
 
1162 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  37.89 
 
 
474 aa  149  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  35.53 
 
 
434 aa  134  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  29.82 
 
 
493 aa  88.6  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  26.22 
 
 
523 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2336  hypothetical protein  45.53 
 
 
144 aa  70.1  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  26.16 
 
 
493 aa  57  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11570  hypothetical protein  32.95 
 
 
527 aa  51.6  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32459  predicted protein  45.05 
 
 
848 aa  48.5  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  26.55 
 
 
513 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  30.68 
 
 
498 aa  47  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_50390  probable cell surface glycoprotein  46.75 
 
 
623 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0151497  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  40.68 
 
 
533 aa  44.3  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>