14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_6210 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  940    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  38.68 
 
 		 857 aa  226  5.0000000000000005e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  36.3 
 
 		 474 aa  180  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.75 
 
 		 1162 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3486  hypothetical protein  42.86 
 
 		 604 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.621993 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  38.86 
 
 		 434 aa  130  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  32.62 
 
 		 493 aa  96.7  9e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  26.1 
 
 		 523 aa  85.9  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2336  hypothetical protein  47.83 
 
 		 144 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11570  hypothetical protein  35.57 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  29.58 
 
 		 493 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  31.16 
 
 		 498 aa  53.5  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  28.03 
 
 		 513 aa  49.3  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  28.19 
 
 		 508 aa  46.6  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>