16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6331 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4584  hypothetical protein  76.51 
 
 
514 aa  695    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  971    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  40 
 
 
513 aa  277  3e-73  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  40.88 
 
 
493 aa  269  8e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  37.66 
 
 
508 aa  225  1e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  28.51 
 
 
493 aa  69.3  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3019  hypothetical protein  24.91 
 
 
556 aa  67.4  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0834765  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3016  hypothetical protein  23.46 
 
 
538 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0384836 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0238  hypothetical protein  23.6 
 
 
462 aa  61.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  29.72 
 
 
857 aa  57.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  27.36 
 
 
523 aa  53.9  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  30.62 
 
 
474 aa  52  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  29.49 
 
 
434 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  31.16 
 
 
493 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11570  hypothetical protein  26.91 
 
 
527 aa  45.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.07 
 
 
1162 aa  43.1  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>