14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3303 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  100 
 
 		 513 aa  1016    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  37.5 
 
 		 493 aa  309  8e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  40.57 
 
 		 498 aa  296  5e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4584  hypothetical protein  39.06 
 
 		 514 aa  251  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  35.22 
 
 		 508 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  27.78 
 
 		 493 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3019  hypothetical protein  24.8 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0834765  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  24.78 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3016  hypothetical protein  22.31 
 
 		 538 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0384836 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  28.52 
 
 		 857 aa  61.6  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0238  hypothetical protein  20.92 
 
 		 462 aa  54.3  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  32.35 
 
 		 493 aa  51.2  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.64 
 
 		 1162 aa  51.2  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  27.3 
 
 		 474 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>