11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3334 on replicon NC_008043
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  100 
 
 		 508 aa  1010    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  37.66 
 
 		 498 aa  230  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  35.22 
 
 		 513 aa  209  9e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  34.98 
 
 		 493 aa  203  8e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4584  hypothetical protein  35.39 
 
 		 514 aa  196  6e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3016  hypothetical protein  22.43 
 
 		 538 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0384836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  31.08 
 
 		 493 aa  72.8  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3019  hypothetical protein  26.72 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0834765  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0238  hypothetical protein  23.97 
 
 		 462 aa  53.5  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  27.44 
 
 		 523 aa  52.8  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  32.3 
 
 		 857 aa  51.2  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>