15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4584 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4584  hypothetical protein  100 
 
 
514 aa  1016    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  76.51 
 
 
498 aa  742    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  42.2 
 
 
493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  38.35 
 
 
513 aa  263  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  34.82 
 
 
508 aa  219  6e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3016  hypothetical protein  24.62 
 
 
538 aa  74.3  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0384836 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3019  hypothetical protein  24.16 
 
 
556 aa  73.6  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0834765  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  27.16 
 
 
493 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0238  hypothetical protein  28.24 
 
 
462 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266046  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  30.09 
 
 
857 aa  57  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  26.46 
 
 
523 aa  48.5  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  25.08 
 
 
1162 aa  48.5  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  31.22 
 
 
434 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  28.08 
 
 
474 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  28.36 
 
 
493 aa  43.5  0.009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>