12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_3418 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_3418  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1046    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.377883  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5524  histidine kinase  30.41 
 
 		 857 aa  83.6  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4871  hypothetical protein  30.48 
 
 		 493 aa  81.6  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6210  hypothetical protein  29.82 
 
 		 493 aa  74.3  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11570  hypothetical protein  23.21 
 
 		 527 aa  70.1  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1550  Signal transduction histidine kinase-like protein  28.52 
 
 		 1162 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4323  hypothetical protein  25.37 
 
 		 493 aa  59.3  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3303  hypothetical protein  25.22 
 
 		 513 aa  58.5  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.124678  normal  0.407107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3567  hypothetical protein  23.6 
 
 		 474 aa  58.9  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6331  hypothetical protein  24.38 
 
 		 498 aa  54.7  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00569126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3334  hypothetical protein  23.26 
 
 		 508 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.881779  normal  0.501512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0432  signal transduction histidine kinase-like protein  24.22 
 
 		 434 aa  48.5  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.986525  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>