133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_R0001 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_R0001  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.959886  normal  0.621244 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0002  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0907588  normal  0.790513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_R0003  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 111 bp  220  6e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.641144 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0001  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 110 bp  141  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.119355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_R0002  5S ribosomal RNA  91.89 
 
 		 110 bp  141  3.9999999999999997e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.84828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0014  5S ribosomal RNA  90.09 
 
 		 110 bp  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.320742  normal  0.807419 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0037  5S ribosomal RNA  95.95 
 
 		 114 bp  123  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0054  5S ribosomal RNA  89.19 
 
 		 115 bp  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0106788 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0014  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0019  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0027  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0032  5S ribosomal RNA  93.18 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.998311  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_R0024  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 123 bp  61.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0034  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.480679  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0043  5S ribosomal RNA  97.06 
 
 		 117 bp  60  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.240203  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0013  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0014  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0041  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0042  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0057  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0058  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0061  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 116 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0062  5S ribosomal RNA  92.5 
 
 		 117 bp  56  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0050  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000265937  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0016  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 115 bp  54  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0015  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0047  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0292676  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0031  5S ribosomal RNA  94.29 
 
 		 117 bp  54  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000618538  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_R0082  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0055  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.831714  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0067  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.360556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_R0075  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00798302  normal  0.222372 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0006  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 115 bp  50.1  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0364789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0012  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0017  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 114 bp  50.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0015  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.299656 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0030  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0058  5S ribosomal RNA  93.94 
 
 		 122 bp  50.1  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000016454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4293  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4357  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 115 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_r01  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0022  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0790394  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0039  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0019  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.507322  normal  0.482048 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0036  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0862366  normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 113 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0040  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 113 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0277328  normal  0.0318145 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0006  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.545008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0054  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0061  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0067  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 118 bp  48.1  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.271242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0019  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329841  normal  0.0964141 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0036  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 114 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.481647  hitchhiker  0.00452682 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0025  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 112 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.109821 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0038  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 112 bp  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.283696 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0067  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.107142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0068  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.106732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0066  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.225371  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0065  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.22453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0077  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0076  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0055  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.579519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0054  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0035  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0032  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00233043  normal  0.030987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0033  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00237369  normal  0.031126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0050  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00286866  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0051  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00290492  normal  0.0194127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0065  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 116 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0841821  normal  0.044822 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0066  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0845472  normal  0.0450161 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05580  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 129 bp  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07460  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 129 bp  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.875946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25510  5S ribosomal RNA  91.67 
 
 		 129 bp  48.1  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0021  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0022  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.631402 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0034  5S ribosomal RNA  93.75 
 
 		 117 bp  48.1  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.457596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0042  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.1617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0065  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0015  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0034  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0005  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00187724  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0036  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0040  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 115 bp  46.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.852672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0025  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.102792  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0036  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.484974  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0050  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00973992  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0060  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.136348  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0026  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 128 bp  46.1  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0028  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.349072  normal  0.465513 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0039  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0009  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0030  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 114 bp  46.1  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0026  5S ribosomal RNA  88.37 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.255139  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0037  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.219392 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0014  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0011  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0005  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0009  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0647002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0025  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 117 bp  46.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0315832  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0035  5S ribosomal RNA  91.43 
 
 		 116 bp  46.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>