26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_12620 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_12620  predicted phosphatase  100 
 
 
298 aa  619  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0982  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  49.39 
 
 
269 aa  214  1.9999999999999998e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.367355 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07140  predicted phosphatase  43.57 
 
 
239 aa  177  2e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.580043 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2074  hydrolase  36.24 
 
 
235 aa  154  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0658329  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2094  hydrolase  34.02 
 
 
283 aa  142  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000451147  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0754  hydrolase  36.51 
 
 
240 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00261595  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0542  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 
242 aa  115  8.999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.657376 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2046  hypothetical protein  30.71 
 
 
235 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18050  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  37.67 
 
 
208 aa  97.8  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1690  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.02 
 
 
237 aa  97.4  3e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3082  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.64 
 
 
231 aa  89.4  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.378821  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0172  hydrolase  31.14 
 
 
243 aa  85.1  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2947  HAD superfamily hydrolase  27.1 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0624  hydrolase  28.86 
 
 
208 aa  73.9  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0996  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.196077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1134  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
200 aa  67.8  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3704  pyrophosphatase PpaX  27.27 
 
 
212 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2124  phosphoglycolate phosphatase  24.63 
 
 
230 aa  46.2  0.0007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.305125  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2760  putative phosphoglycolate phosphatase  25.25 
 
 
221 aa  45.1  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0219607 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  42.59 
 
 
231 aa  45.4  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2446  phosphoglycolate phosphatase  24.14 
 
 
225 aa  45.4  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2091  phosphoglycolate phosphatase  25.24 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2473  HAD family hydrolase  22.77 
 
 
248 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000591891  hitchhiker  0.00615598 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  38.6 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  38.6 
 
 
230 aa  42.7  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0057  phosphoglycolate phosphatase  24.63 
 
 
232 aa  42.4  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.049028  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>