200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08560 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_08560  rubrerythrin  100 
 
 		 179 aa  376  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.249013 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12890  rubrerythrin  79.33 
 
 		 179 aa  306  1.0000000000000001e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0524  rubrerythrin  62.15 
 
 		 179 aa  240  9e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0999  hypothetical protein  63.28 
 
 		 180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0268457  normal  0.36555 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1869  Rubrerythrin  61.58 
 
 		 179 aa  235  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.390232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0122  Rubrerythrin  61.45 
 
 		 181 aa  229  1e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000148271  normal  0.250808 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1036  rubrerythrin  60.89 
 
 		 179 aa  230  1e-59  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.264339  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2313  Rubrerythrin  61.24 
 
 		 178 aa  223  9e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000307395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1910  Rubrerythrin  61.24 
 
 		 178 aa  222  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.43857 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0163  Rubrerythrin  62.92 
 
 		 178 aa  220  6e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000002418  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0847  rubrerythrin  55.87 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490534  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0840  rubrerythrin  55.87 
 
 		 179 aa  215  2.9999999999999998e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2346  rubrerythrin  55.26 
 
 		 190 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000333134  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1076  [Fe] hydrogenase  56.82 
 
 		 696 aa  206  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.723256  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12020  rubrerythrin  57.14 
 
 		 221 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000256435  normal  0.664088 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2797  rubrerythrin  55.93 
 
 		 178 aa  204  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.31636e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0938  periplasmic [Fe] hydrogenase 1  55.68 
 
 		 696 aa  204  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0625857  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2716  Rubrerythrin  51.58 
 
 		 190 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.275247 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1286  rubrerythrin  52.66 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0599979  hitchhiker  0.000011253 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2647  rubrerythrin  51.6 
 
 		 191 aa  199  1.9999999999999998e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3459  Rubrerythrin  51.6 
 
 		 192 aa  197  5e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1205  Rubrerythrin  53.19 
 
 		 192 aa  197  7.999999999999999e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.521926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2235  Rubrerythrin  52.57 
 
 		 392 aa  196  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00102881  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1311  rubrerythrin  52.63 
 
 		 190 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.395984  normal  0.0129823 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0009  rubrerythrin  51.6 
 
 		 191 aa  195  2.0000000000000003e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.195637  hitchhiker  0.00235505 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0670  rubrerythrin  54.19 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0740275  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2072  Rubrerythrin  51.6 
 
 		 191 aa  195  4.0000000000000005e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.813169  normal  0.122422 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3252  rubrerythrin  50.53 
 
 		 191 aa  194  5.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0543  rubrerythrin  51.69 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.37944  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2212  rubrerythrin  54.19 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1986  Rubrerythrin  53.63 
 
 		 177 aa  191  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.079110000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0860  rubrerythrin  48.45 
 
 		 197 aa  190  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.069269  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0195  rubrerythrin  47.87 
 
 		 192 aa  186  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.766512 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1797  Rubrerythrin  47.34 
 
 		 192 aa  184  5e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0136768  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2277  rubrerythrin  48.42 
 
 		 190 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.197935  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2276  rubrerythrin  47.89 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.430774 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1222  rubrerythrin  49.19 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000000672055  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2367  Rubrerythrin  47.59 
 
 		 191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.565711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2264  Rubrerythrin  45.92 
 
 		 196 aa  181  7e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0219984  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0285  rubrerythrin  46.81 
 
 		 191 aa  181  7e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.026265 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0133  rubrerythrin  48.44 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000905635  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0132  rubrerythrin  48.44 
 
 		 195 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1965  rubrerythrin  47.34 
 
 		 191 aa  179  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00228469  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2814  rubrerythrin  46.84 
 
 		 190 aa  179  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.773613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1680  Rubrerythrin  47.34 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2379  rubrerythrin  48.94 
 
 		 191 aa  179  2e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0439288  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0434  rubrerythrin  44.68 
 
 		 191 aa  171  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0667  rubrerythrin  46.28 
 
 		 191 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.946538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0633  Rubrerythrin  47.25 
 
 		 191 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000654398  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2613  rubrerythrin  44.97 
 
 		 191 aa  167  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000875235  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1657  Rubrerythrin  45.41 
 
 		 196 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0382  Rubrerythrin  41.97 
 
 		 194 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000024183  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1668  Rubrerythrin  43.1 
 
 		 233 aa  152  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.428689 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1538  rubrerythrin  42.29 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0174784  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1331  rubrerythrin  42.29 
 
 		 178 aa  149  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0282824  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0893  Rubrerythrin  39.68 
 
 		 194 aa  147  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.180396  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1565  rubrerythrin  38.54 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1657  rubrerythrin  39.06 
 
 		 194 aa  145  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0972  rubrerythrin  38.54 
 
 		 194 aa  144  1e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.367114  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0256  rubrerythrin  38.54 
 
 		 194 aa  143  2e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1247  Rubrerythrin  46.06 
 
 		 165 aa  141  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1319  Rubrerythrin  46.15 
 
 		 216 aa  140  9e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000115937  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0323  rubrerythrin  44.12 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.280139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1910  enolase (2-phosphoglycerate dehydratase; 2-phospho-D-glycerate hydro-lyase)  44.05 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000289321  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0325  rubrerythrin  38.34 
 
 		 195 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.560367  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1185  Rubrerythrin  40 
 
 		 164 aa  136  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000958071  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0081  rubrerythrin  43.79 
 
 		 215 aa  134  9.999999999999999e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0011  rubrerythrin  43.2 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0012  rubrerythrin  43.2 
 
 		 183 aa  132  3.9999999999999996e-30  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000245189  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0038  rubrerythrin  43.2 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0308291  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0406  rubrerythrin/rubredoxin  35.93 
 
 		 165 aa  108  5e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1978  rubrerythrin  38.18 
 
 		 166 aa  105  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.603623  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2201  Rubrerythrin  42.75 
 
 		 140 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0203329 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0835  Rubrerythrin  41.73 
 
 		 139 aa  106  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000345358  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1646  Rubrerythrin  41.51 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.636053 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0811  rubrerythrin  44.85 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0402647 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1847  rubrerythrin  41.61 
 
 		 139 aa  105  4e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000655626  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0102  Rubrerythrin  35.12 
 
 		 172 aa  104  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000956858  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0418  Rubrerythrin  40.58 
 
 		 139 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0385  rubrerythrin  35.5 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3154  rubrerythrin  35.54 
 
 		 166 aa  103  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2460  Rubrerythrin  38.55 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0765  rubrerythrin  42.65 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0816  Rubrerythrin  42.65 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.850506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0743  rubrerythrin  35.93 
 
 		 165 aa  102  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3282  rubrerythrin  37.74 
 
 		 166 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000199245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0812  Rubrerythrin  42.34 
 
 		 139 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1794  Rubrerythrin  38.46 
 
 		 168 aa  102  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00000201822  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4153  rubrerythrin  38.46 
 
 		 168 aa  101  4e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1644  Rubrerythrin  39.05 
 
 		 164 aa  102  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2624  rubrerythrin  35.5 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1571  rubrerythrin  36.69 
 
 		 166 aa  101  6e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2193  rubrerythrin  36.14 
 
 		 166 aa  101  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.336695  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1684  Rubrerythrin  36.14 
 
 		 166 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.928026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3111  rubrerythrin  40.71 
 
 		 146 aa  100  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.561789  normal  0.345074 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_349  rubrerythrin/rubredoxin  33.73 
 
 		 165 aa  99.8  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4924  rubrerythrin  42.65 
 
 		 140 aa  99.8  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0358727 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0453  Rubrerythrin  36.88 
 
 		 144 aa  99  3e-20  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1807  rubrerythrin  40.71 
 
 		 146 aa  99  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.320869  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2674  rubrerythrin  40.15 
 
 		 139 aa  99  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>