182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_07580 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_07580  tRNA-Asn  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.16811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0023  tRNA-Asn  97.33 
 
 		 75 bp  133  6e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0800816  normal  0.0382047 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0046  tRNA-Asn  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000438638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0027  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0226012  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0013  tRNA-Asn  94.12 
 
 		 75 bp  103  6e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0043  tRNA-Asn  92 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06350  tRNA-Asn  92.54 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09540  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0127203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0018  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.723624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0041  tRNA-Asn  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.210867  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0019  tRNA-Asn  92.75 
 
 		 73 bp  89.7  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.615081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0053  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0280094  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0030  tRNA-Asn  91.04 
 
 		 73 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0075  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000782806  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0081  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0021  tRNA-Asn  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000441917  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0034    88.57 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.025116  hitchhiker  0.0090759 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0047  tRNA-Asn  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000251185  normal  0.812325 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0008  tRNA-Asn  89.39 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0851483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0010  tRNA-Asn  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00716617  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0008  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14025  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11930  tRNA-Asn  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0127142  normal  0.206625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0028  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.246384  normal  0.65431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0041  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000401156  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0033  tRNA-Asn  89.83 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179763  normal  0.590864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA44  tRNA-Asn  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366326  normal  0.398045 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0037  tRNA-Asn  90.74 
 
 		 72 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0032  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.260043  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0029  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0716231  normal  0.649346 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0029  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.289223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13840  tRNA-Asn  95.12 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.305129  normal  0.453379 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0033  tRNA-Asn  86.3 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000143067  hitchhiker  0.0000025916 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0014  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.11083 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0030  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693953  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0015  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAAsnVIMSS1309217  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0005  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.570068 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAAsnVIMSS1309370  tRNA-Asn  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.434396 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0011  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.36604 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0055  tRNA-Asn  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0338402  normal  0.0404026 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0073  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2505  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2780  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0095  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2211  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2466  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0032  tRNA-Asn  100 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.275296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0075  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0888868  normal  0.929022 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0043  tRNA-Asn  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.696161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0029  tRNA-Asn  85.71 
 
 		 75 bp  60  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  89.8 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5671  tRNA-Asx  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000157902  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5148  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000015109  normal  0.479478 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000140923  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4777  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000213851  hitchhiker  0.0000000000000219436 
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.043106  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5706  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000905345  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0524  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.4385300000000005e-28 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000655937  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0600  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000379275  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0531  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0043  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1748  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000183291  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0077  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000930167  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0017  tRNA-Asn  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000000360028  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0070  tRNA-Asn  91.11 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.213378  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0500  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00327724  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0033  tRNA-Asn  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.104706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0017  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0033  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0102741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0649  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000525296  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0682  tRNA-Asn  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000249623  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0047  tRNA-Met  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00127199  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0020  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0020  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0942184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4590  tRNA-Asn  84.29 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16810  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0598993  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5663  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5656  tRNA-Asx  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000484594  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-1  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000014846  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-2  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0717839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0120777  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000216624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00125687  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-3  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000262097  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-4  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.449639  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Asn-5  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 78 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5743  tRNA-Glu  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000765198  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0124  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0115  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5800  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00845439  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0111  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00999623  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0120  tRNA-Asn  87.76 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0694  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0018  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0030  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.28172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>