More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_04330 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_04330  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  100 
 
 		 138 aa  284  4e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0437  ferric uptake regulator family protein  31.34 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19320  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  31.43 
 
 		 140 aa  70.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000424338 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2717  ferric uptake regulator family protein  33.33 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.519221 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1599  ferric uptake regulator, Fur family  32.82 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.4089  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1379  ferric uptake regulation protein Fur  28.46 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.404925  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2445  ferric uptake regulator family protein  28.46 
 
 		 143 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000164453  normal  0.662654 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0546  ferric uptake regulator family protein  25.76 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05900  ferric uptake regulator, Fur family  24.6 
 
 		 145 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000248432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1587  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 143 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000012945  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12385  ferric uptake regulation protein furB  33.33 
 
 		 130 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.473792  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4234  ferric uptake regulator family protein  30.77 
 
 		 167 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0343972  normal  0.519768 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2626  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 143 aa  67  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13670  zinc uptake regulator, Fur family  32.03 
 
 		 142 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.557708 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3820  ferric uptake regulator family protein  31.71 
 
 		 131 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.396621  normal  0.536437 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3458  zinc uptake regulator  30.3 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.455544  normal  0.210399 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1493  ferric uptake regulator family protein  25.19 
 
 		 146 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000138692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1562  ferric uptake regulator, Fur family  25 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3447  zinc uptake regulator  30.3 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0819749  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3150  ferric-uptake regulator  35.87 
 
 		 137 aa  65.5  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.517881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3510  zinc uptake regulator  30.3 
 
 		 131 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.11469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0170  ferric uptake regulator, Fur family  31.34 
 
 		 139 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0365  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 150 aa  65.1  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0772  ferric uptake regulator family protein  26.77 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.230128  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1905  ferric uptake regulator family protein  27.42 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1228  ferric uptake regulator family protein  29.92 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0650  ferric uptake regulator family protein  25 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000137697  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5908  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 165 aa  63.2  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.616966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3002  ferric uptake regulator family protein  26.15 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000499535  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2468  ferric uptake regulator, Fur family  25.38 
 
 		 146 aa  62.8  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0653957  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1373  ferric uptake regulator, Fur family  27.69 
 
 		 135 aa  62  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000536701  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2401  ferric uptake regulator, Fur family  31.62 
 
 		 141 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2982  ferric uptake regulator, Fur family  24.39 
 
 		 154 aa  61.2  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000154751  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2053  ferric-uptake regulator  28 
 
 		 201 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2340  ferric uptake regulator family protein  34.91 
 
 		 135 aa  61.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0648274  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1586  ferric-uptake regulator  29.2 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.501887  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2790  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000512773  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0529  ferric uptake regulator, Fur family  28.8 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000605392  normal  0.102669 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1555  ferric uptake regulator family protein  29.2 
 
 		 149 aa  60.8  0.000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1138  ferric uptake regulator, Fur family  27.27 
 
 		 143 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.716078  normal  0.825565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1061  FUR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.304588  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0405  ferric uptake regulator family protein  33.01 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165057 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4201  transcriptional regulator, Fur family  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0217905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1036  transcriptional regulator, Fur family  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0163253  normal  0.210334 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4538  ferric uptake regulator family protein  31.45 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0148082  normal  0.344615 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4115  transcriptional regulator, Fur family  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5116299999999997e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4160  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4001  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000832394  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2524  ferric uptake regulator, Fur family  30.33 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.568134  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3832  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3848  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000844204  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4313  FUR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.175912  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2736  helix-turn-helix, AraC type  26.96 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000081899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3922  ferric uptake regulator family protein  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000572819  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4224  transcriptional regulator, Fur family  27.07 
 
 		 151 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00546613  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1147  FUR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2612  ferric uptake regulator, Fur family  29.01 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1261  ferric uptake regulator, Fur family  30.4 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3370  ferric uptake regulator, Fur family  30.3 
 
 		 167 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.073099  normal  0.112136 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3967  ferric uptake regulator family protein  26.96 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.706026 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2543  ferric-uptake regulator  31.25 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.37741  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11938  ferric uptake regulation protein furA (fur)  26.56 
 
 		 150 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1179  Fur family ferric uptake regulator  33.04 
 
 		 142 aa  58.5  0.00000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.462177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2171  ferric uptake regulator, Fur family  32.79 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00854605  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3769  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3508  ferric uptake regulator  27.64 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01120  Fe2+/Zn2+ uptake regulation protein  30.65 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4134  ferric uptake regulator, Fur family  30.63 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1934  zinc uptake regulator  28.93 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.395595  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4174  ferric uptake regulator, Fur family  30.63 
 
 		 132 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0684  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.564127  normal  0.74996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0738  ferric uptake regulator family protein  26.87 
 
 		 142 aa  57.4  0.00000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376687  normal  0.425851 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2745  ferric uptake regulator, Fur family  29.37 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0066  ferric uptake regulator, Fur family  29.03 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3007  ferric uptake regulator family protein  31.88 
 
 		 137 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.830794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1995  ferric uptake regulator, Fur family  26.87 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.134138  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0247  ferric uptake transcriptional (FUR)-like transcription regulator protein  30.33 
 
 		 151 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.406535  normal  0.140515 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3452  ferric uptake regulator family protein  31.13 
 
 		 145 aa  57  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.604214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2725  ferric uptake regulator, Fur family  27.13 
 
 		 152 aa  57  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122956  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2810  ferric uptake regulator  25 
 
 		 143 aa  57  0.00000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.644684  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0294  ferric uptake regulator, Fur family  29.79 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.774382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4397  transcriptional regulator, Fur family  32.61 
 
 		 137 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108592  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0839  transcriptional regulator, Fur family  32.61 
 
 		 128 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.442755  hitchhiker  0.000379655 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4057  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0856  zinc uptake regulator  32.71 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.763265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11800  zinc uptake regulator, Fur family  24.39 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00894406  normal  0.765019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1040  transcriptional regulator, Fur family  27.61 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17110  zinc uptake regulator, Fur family  31.2 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.184262  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3662  ferric uptake regulator, Fur family  30 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2502  ferric uptake regulator  25.2 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000739379  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0224  putative iron-regulated membrane protein  23.36 
 
 		 155 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1842  ferric uptake regulator  25.2 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000000255764  normal  0.0169118 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2622  ferric uptake regulator  25.2 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000743772  normal  0.0672977 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3944  ferric uptake regulator, Fur family  28.46 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.701643  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1211  ferric uptake regulation protein  23.64 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0179394  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1953  ferric uptake regulator family protein  29.46 
 
 		 131 aa  56.6  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1536  ferric uptake regulator, Fur family  31.25 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.451133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2509  ferric uptake regulator  25.2 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000631479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1842  ferric uptake regulator  25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000122874  normal  0.0218944 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1796  ferric uptake regulator  25 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0654147  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>