More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_R0074 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_R0074  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0141721  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0229  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0489  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.107964  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0228  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.883109  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0093  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0094  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0095  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0096  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0097  tRNA-Met  98.68 
 
 		 76 bp  143  7e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0473  tRNA-Met  97.37 
 
 		 76 bp  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0025  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0370437  normal  0.116281 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0027  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0024  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0236841  normal  0.117231 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0031  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0036  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0037  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0025  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0026  tRNA-Met  97.4 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt019  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00289748  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0024  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000264757  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0014  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000138583  hitchhiker  0.00843441 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0083  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000703171  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2792  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000935283  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2795  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000169803  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2478  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00948036  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2481  tRNA-Met  96.05 
 
 		 76 bp  127  4.0000000000000003e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000303707  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3203t  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3197t  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3199t  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.976924  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3201t  tRNA-Met  97.3 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0055  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0073  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000821998  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0084  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0249486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0063  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00364456  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0012  tRNA-Met  96.1 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0007  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.269923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0026  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  6.52648e-26  unclonable  0.0000000488908 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0014  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0042  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.324618  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_BR0086  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t058  tRNA-Met  96.05 
 
 		 77 bp  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0442009  hitchhiker  0.000269982 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0019  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0324694  normal  0.0212218 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0024  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0898053 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0062  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0560501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0048  tRNA-Met  94.74 
 
 		 76 bp  119  9.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00409102  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3204t  tRNA-Met  97.18 
 
 		 74 bp  117  3.9999999999999997e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-3  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.589398  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-4  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.567742  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Met-5  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0088  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0177  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.202779  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0033  tRNA-Met  95.95 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0064  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0091  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0092  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0060  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00315069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0053  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.896198 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0058  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00863094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0057  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.88568 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0107  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0531774  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0112  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0139915  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0088  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0061  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00126758  hitchhiker  0.000243294 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0056  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.880459 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0052  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.902877 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0110  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0138501  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0057  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00956422  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA21  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.929438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA22  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.531556  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0077  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852479  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0055  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.867908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0063  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00314729  hitchhiker  0.000241423 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0093  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0090  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0059  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00352122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0068  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00886368  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0067  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00450958  hitchhiker  0.000893697 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0079  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0080  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0081  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0082  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0087  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0109101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0108  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0137063  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0089  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0114933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0076  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.195191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0098  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.514232  decreased coverage  0.00128262 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0099  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.69188  decreased coverage  0.00129939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0078  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0079  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0054  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.871356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0101  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.893911  decreased coverage  0.00145589 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0078  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0634809  normal  0.33041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0079  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.060888  normal  0.335766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0062  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00124144  hitchhiker  0.000239512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0066  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00171075  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0064  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0037637  hitchhiker  0.000249048 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0100  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.925668  decreased coverage  0.00140231 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0065  tRNA-Met  94.81 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0014321  hitchhiker  0.000837814 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>