89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2309 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2309  arsenate reductase and related  100 
 
 
111 aa  227  5e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2937  arsenate reductase and related  58.04 
 
 
112 aa  137  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0973954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2231  arsenate reductase and related  58.04 
 
 
112 aa  135  2e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.376632  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1470  arsenate reductase and related  51.33 
 
 
113 aa  117  6e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.222318  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0726  arsenate reductase and related  48.67 
 
 
110 aa  104  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000014024  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0403  arsenate reductase and related  35.71 
 
 
118 aa  80.9  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1805  arsenate reductase-like protein  35.65 
 
 
116 aa  75.9  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2552  arsenate reductase and related  28.83 
 
 
113 aa  69.3  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0688567  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1151  arsenate reductase and related  31.43 
 
 
112 aa  61.2  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3594  arsenate reductase  30.63 
 
 
117 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2487  arsenate reductase and related  27.43 
 
 
118 aa  55.1  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.247557  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2210  hypothetical protein  27.27 
 
 
116 aa  53.9  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.586294  normal  0.0446547 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2740  arsenate reductase and related  29.57 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.520955  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2230  arsenate reductase and related  29.57 
 
 
128 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3375  arsenate reductase and related  26.05 
 
 
135 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.956996  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4291  arsenate reductase and related  26.13 
 
 
116 aa  50.8  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.749757 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1081  arsenate reductase and related  28.04 
 
 
120 aa  50.4  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1671  hypothetical protein  25 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.352344  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1840  arsenate reductase  24.27 
 
 
120 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.455524  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3058  arsenate reductase and related  28.04 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0418567  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2033  hypothetical protein  24.11 
 
 
121 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16970  arsenate reductase glutaredoxin family protein  26.61 
 
 
115 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0749419  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0478  arsenate reductase and related  25.44 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2975  arsenate reductase and related  30.21 
 
 
127 aa  49.7  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0348803  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4555  arsenate reductase and related  26.13 
 
 
116 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.944754  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3508  arsenate reductase and related  25.23 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4193  arsenate reductase and related  26.13 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.597489  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3754  hypothetical protein  27.43 
 
 
118 aa  48.9  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1087  arsenate reductase and related  27.52 
 
 
114 aa  48.1  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.95059 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1017  arsenate reductase and related  29.81 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1475  hypothetical protein  26.61 
 
 
115 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0384  hypothetical protein  26.17 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0369  hypothetical protein  26.17 
 
 
116 aa  47.8  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3500  hypothetical protein  24.56 
 
 
121 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2328  hypothetical protein  24.11 
 
 
115 aa  47.8  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0361475  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0484  hypothetical protein  27.52 
 
 
117 aa  47.4  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1531  arsenate reductase and related  25.23 
 
 
115 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.115658 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1140  arsenate reductase and related  25.23 
 
 
118 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.919119  normal  0.651157 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1170  hypothetical protein  23.48 
 
 
125 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00368866  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1357  hypothetical protein  28.3 
 
 
118 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1030  arsenate reductase-like protein  25.74 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3763  arsenate reductase and related  27.27 
 
 
124 aa  46.2  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4378  arsenate reductase and related  25 
 
 
115 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1094  hypothetical protein  23.85 
 
 
113 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.938878  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4088  arsenate reductase and related  25.23 
 
 
121 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2605  hypothetical protein  24.76 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.273985  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1359  arsenate reductase  26.8 
 
 
133 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00176431  normal  0.0126888 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4773  arsenate reductase and related  25 
 
 
119 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0851836 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2747  hypothetical protein  26.42 
 
 
126 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.462995 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2687  hypothetical protein  27.1 
 
 
131 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2957  hypothetical protein  25.45 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.93361  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1337  hypothetical protein  24.32 
 
 
115 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0868084 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0577  arsenate reductase  27.18 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1602  hypothetical protein  25.96 
 
 
116 aa  44.7  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2247  arsenate reductase-like protein  22.73 
 
 
120 aa  44.7  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2514  arsenate reductase and related  23.89 
 
 
115 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.226515  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1256  hypothetical protein  26.6 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3142  hypothetical protein  26.6 
 
 
132 aa  44.3  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0134  hypothetical protein  25 
 
 
119 aa  43.9  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1373  hypothetical protein  26.6 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51980  putative arsenate reductase  23.58 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00081226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3573  arsenate reductase and related  24.07 
 
 
115 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.681752  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0011  hypothetical protein  25.45 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1157  arsenate reductase  26.85 
 
 
130 aa  42.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.626027  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1529  arsC family protein  22.52 
 
 
115 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2417  hypothetical protein  23.21 
 
 
114 aa  42  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156213  decreased coverage  0.000000935977 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0576  transcriptional regulator Spx  27.84 
 
 
131 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.926413  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4992  arsenate reductase and related  26.55 
 
 
118 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.439815 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0996  transcriptional regulator Spx  27.84 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.444698  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39080  arsC family protein  22.22 
 
 
118 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.173887  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0567  arsenate reductase and related  28.87 
 
 
133 aa  42  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1015  transcriptional regulator Spx  27.84 
 
 
131 aa  41.6  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000679905  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2189  arsenate reductase and related  25 
 
 
114 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825632 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3168  hypothetical protein  24.77 
 
 
115 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.533706  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1766  hypothetical protein  23.01 
 
 
113 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.921595  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2092  transcriptional regulator Spx  25.93 
 
 
132 aa  41.2  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00819419  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0744  arsenate reductase  26.32 
 
 
118 aa  41.2  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000148038  hitchhiker  0.000145224 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2438  arsenate reductase  22.86 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00647081 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1914  arsenate reductase  22.86 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.204122  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1858  hypothetical protein  22.12 
 
 
134 aa  41.2  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000117045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2120  hypothetical protein  22.12 
 
 
134 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00136952 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2675  hypothetical protein  24.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2715  hypothetical protein  24.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0814882 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2626  hypothetical protein  24.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2848  hypothetical protein  24.76 
 
 
118 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4559  putative arsenate reductase  19.81 
 
 
117 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.720566  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0911  arsenate reductase  24.07 
 
 
142 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0335675  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1618  transcriptional regulator Spx  25.93 
 
 
132 aa  40  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2966  hypothetical protein  24.47 
 
 
115 aa  40  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.489852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>