49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4347 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4347  hypothetical protein  100 
 
 
125 aa  246  6e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.37521 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3228  hypothetical protein  41.32 
 
 
121 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.604318  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3127  hypothetical protein  42.15 
 
 
121 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3030  hypothetical protein  43.52 
 
 
121 aa  104  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0362  hypothetical protein  38.1 
 
 
125 aa  98.2  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179708  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4348  hypothetical protein  43.17 
 
 
137 aa  98.2  3e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.67611  normal  0.378671 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2138  hypothetical protein  45.08 
 
 
128 aa  97.8  4e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0323108 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0963  membrane protein-like protein  37.93 
 
 
122 aa  86.7  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.186902  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1256  membrane protein-like protein  42.31 
 
 
128 aa  83.2  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.18345  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3097  hypothetical protein  38.14 
 
 
122 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.252756  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1016  hypothetical protein  43.24 
 
 
112 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0526  membrane protein-like  49.5 
 
 
119 aa  81.6  0.000000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000156824  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3238  hypothetical protein  37.9 
 
 
120 aa  79.7  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.616877  normal  0.598672 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2121  hypothetical protein  41.88 
 
 
131 aa  75.9  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.626034 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3132  hypothetical protein  39.36 
 
 
115 aa  70.9  0.000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0836  hypothetical protein  33.33 
 
 
127 aa  70.5  0.000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.890554  hitchhiker  0.00606656 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2838  membrane protein-like  38.05 
 
 
122 aa  70.5  0.000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1797  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3657  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3715  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2756  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3248  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2705  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3684  hypothetical protein  34.71 
 
 
129 aa  68.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2984  hypothetical protein  35.71 
 
 
129 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1218  transmembrane protein  35.04 
 
 
118 aa  66.6  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2483  transmembrane protein  34.82 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.226347 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0407  hypothetical protein  34.96 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3551  hypothetical protein  35.65 
 
 
131 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0392282  hitchhiker  0.000178904 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2943  hypothetical protein  35.04 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3220  putative transmembrane protein  36.19 
 
 
124 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.300525  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0361  membrane protein  34.11 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0352  membrane protein  33.33 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0413  membrane protein  34.15 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0113586 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2673  membrane protein  34.15 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.766452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0434  membrane protein  34.15 
 
 
130 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.455263  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2873  hypothetical protein  35.24 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0329049 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2750  hypothetical protein  33.87 
 
 
131 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0677  hypothetical protein  39.36 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3532  membrane protein  34.78 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.22213  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0879  membrane protein-like protein  35.45 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.704776 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0894  membrane protein-like protein  29.09 
 
 
125 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.952804 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0337  membrane protein  34.68 
 
 
130 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.173405  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2514  membrane protein-like  31.19 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.607723  normal  0.251926 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3239  hypothetical protein  28.12 
 
 
130 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3102  transmembrane protein  28.97 
 
 
129 aa  47.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.766019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1100  putative transmembrane protein  22.92 
 
 
149 aa  46.6  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.664506  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4291  hypothetical protein  34.48 
 
 
136 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0419  hypothetical protein  30.67 
 
 
133 aa  40  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0644826 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>