35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1408 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1408  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  100 
 
 
478 aa  954    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0557  hypothetical protein  27.55 
 
 
382 aa  90.9  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.802956 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3232  hypothetical protein  26.48 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000018306  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0605  hypothetical protein  28.46 
 
 
422 aa  84  0.000000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00389442 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4068  hypothetical protein  29.09 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.233618 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.57 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0032  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  58.54 
 
 
323 aa  53.5  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0581  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  50 
 
 
330 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000627689  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3994  peptidoglycan binding domain-containing protein  43.4 
 
 
266 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2683  NLP/P60 protein  56.41 
 
 
232 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.65308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4311  peptidoglycan binding domain-containing protein  42.59 
 
 
305 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3181  carboxyl-terminal protease  38.81 
 
 
482 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9044  cell wall hydrolase/autolysin  43.94 
 
 
381 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4725  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  44.44 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4087  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.74 
 
 
249 aa  47.4  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19660  periplasmic component of the Tol biopolymer transport system  35.51 
 
 
1059 aa  46.6  0.0009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.26793  hitchhiker  0.00572239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2934  Peptidoglycan-binding domain 1 protein  39.47 
 
 
391 aa  46.2  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2150  cell wall hydrolase/autolysin  53.66 
 
 
378 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0025  peptidoglycan binding domain-containing protein  29 
 
 
1261 aa  46.2  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.861527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1812  peptidoglycan binding domain-containing protein  53.66 
 
 
77 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00132339  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8817  hypothetical protein  47.17 
 
 
276 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.432511  normal  0.0471725 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4218  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  40.35 
 
 
320 aa  45.8  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3627  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.98 
 
 
309 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000535955  normal  0.374081 
 
 
-
 
NC_003296  RS03184  putative transglycosylase protein  46.43 
 
 
390 aa  45.1  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0378496  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5086  cell wall hydrolase/autolysin  51.28 
 
 
383 aa  45.1  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2998  carboxyl-terminal protease  36 
 
 
480 aa  45.1  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000384491  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1348  peptidoglycan-binding domain 1 protein  40.74 
 
 
270 aa  44.7  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00397978 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1709  spore cortex-lytic enzyme  47.83 
 
 
267 aa  43.9  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.233149  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1706  lytic murein transglycosylase  37.31 
 
 
454 aa  43.9  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3020  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.51 
 
 
243 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000912863  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2632  peptidoglycan binding domain-containing protein  36.07 
 
 
116 aa  43.5  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9263  hypothetical protein  41.51 
 
 
381 aa  43.5  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.553952 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0480  peptidase S41  35.51 
 
 
1016 aa  43.5  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.359611  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1933  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  45.24 
 
 
417 aa  43.5  0.009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000147149  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  35.71 
 
 
283 aa  43.1  0.01  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>