21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1348 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1348  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 221 aa  448  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2069  TPR repeat  57.47 
 
 		 230 aa  241  3.9999999999999997e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0705  TPR repeat-containing protein  48.62 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1800  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  48.4 
 
 		 227 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0480  TPR repeat-containing protein  43.46 
 
 		 230 aa  151  5.9999999999999996e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1777  Tetratricopeptide domain protein  32.54 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1657  tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.94 
 
 		 233 aa  79.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5634  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.43 
 
 		 231 aa  78.2  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1798  Tetratricopeptide domain protein  33.16 
 
 		 235 aa  73.6  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3719  TPR domain-containing protein  28.8 
 
 		 213 aa  73.2  0.000000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0533  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.61 
 
 		 223 aa  71.2  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000139229 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3815  Tetratricopeptide domain protein  30.43 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.165621  normal  0.472906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0213  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5454  Tetratricopeptide domain protein  25.13 
 
 		 237 aa  57.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.525083 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0326  TPR repeat-containing protein  26.11 
 
 		 262 aa  57.8  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0496  hypothetical protein  24.86 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1430  TPR domain-containing protein  25 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.480041 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0757  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 264 aa  53.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09778  hypothetical protein  33.03 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.685186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2073  TPR domain-containing protein  27.88 
 
 		 417 aa  47.4  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0409184  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  28.95 
 
 		 782 aa  41.6  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>