29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6975 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6975  phosphoribosylglycinamide synthetase  100 
 
 		 398 aa  806    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.646892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6302  hypothetical protein  67.33 
 
 		 401 aa  557  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1164  protein of unknown function DUF201  22.9 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4648  protein of unknown function DUF201  30.71 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.896666  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2987  phosphoribosylglycinamide synthetase  23.17 
 
 		 410 aa  59.7  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000000875543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0170  phosphoribosylglycinamide synthetase ATP-grasp domain-containing protein  25.71 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0292  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp  25.71 
 
 		 407 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1929  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  24.78 
 
 		 411 aa  57  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33390  biotin carboxylase  28.27 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2002  argininosuccinate lyase  29.81 
 
 		 900 aa  54.3  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.848902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2158  argininosuccinate lyase  29.81 
 
 		 914 aa  53.9  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37420  biotin carboxylase  24.56 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.442231 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7724  putative biotin carboxylase  32.11 
 
 		 430 aa  52.8  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.211642  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2026  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  25.44 
 
 		 423 aa  52.8  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1553  phosphoribosylglycinamide synthetase, ATP-grasp, putative  26.16 
 
 		 267 aa  51.6  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2022  argininosuccinate lyase  29.43 
 
 		 900 aa  51.6  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10658  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0573  phosphoribosylglycinamide synthetase  27.46 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.23534  normal  0.22349 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22630  biotin carboxylase  35.71 
 
 		 333 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.405302 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7725  hypothetical protein  30.4 
 
 		 411 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10668  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0200  hypothetical protein  25.1 
 
 		 405 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.214933  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3626  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  28.09 
 
 		 432 aa  48.1  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5770  hypothetical protein  28.91 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0282385 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5090  hypothetical protein  28.91 
 
 		 453 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6391  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 		 403 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.782672  normal  0.167257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6150  ATP-dependent carboxylate-amine ligase domain protein ATP-grasp  26.43 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.639194 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5882  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.47867 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5518  phosphoribosylglycinamide synthetase  29.41 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.398662  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0481  protein of unknown function DUF201  31.07 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0585  D-alanine--D-alanine ligase  23.81 
 
 		 313 aa  43.5  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.034882  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>