39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5841 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5841  hypothetical protein  100 
 
 
289 aa  565  1e-160  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.322989  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5140  hypothetical protein  49.08 
 
 
265 aa  220  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5403  hypothetical protein  44.24 
 
 
263 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.36525 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1432  hypothetical protein  42.91 
 
 
268 aa  216  4e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.762599  normal  0.87586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4754  hypothetical protein  48.71 
 
 
265 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.290335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4840  hypothetical protein  48.71 
 
 
265 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2803  hypothetical protein  43.87 
 
 
265 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5656  hypothetical protein  45.34 
 
 
257 aa  202  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5355  hypothetical protein  46.01 
 
 
266 aa  201  9e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5353  hypothetical protein  42.75 
 
 
304 aa  189  5e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1804  hypothetical protein  39.27 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.863442  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6611  hypothetical protein  35.58 
 
 
246 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27384  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3023  hypothetical protein  36.04 
 
 
263 aa  165  8e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3079  hypothetical protein  37.68 
 
 
240 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5288  hypothetical protein  37.68 
 
 
240 aa  161  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4980  hypothetical protein  37.32 
 
 
240 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2600  hypothetical protein  34.83 
 
 
246 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000803588  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5086  hypothetical protein  34.89 
 
 
255 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0755005  normal  0.0704408 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4648  hypothetical protein  34.85 
 
 
239 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.690095 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3463  hypothetical protein  36.5 
 
 
252 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0360  hypothetical protein  34.42 
 
 
240 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.171003  normal  0.610905 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3242  hypothetical protein  38.85 
 
 
265 aa  152  8e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.766904  normal  0.363076 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 
255 aa  150  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5177  hypothetical protein  34.78 
 
 
240 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.237679 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2249  hypothetical protein  38.87 
 
 
252 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3173  hypothetical protein  33.09 
 
 
248 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.363559  normal  0.380855 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0019  hypothetical protein  39.04 
 
 
250 aa  139  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2503  hypothetical protein  35.96 
 
 
238 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.155963 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0164  hypothetical protein  35.74 
 
 
263 aa  135  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4865  hypothetical protein  38.57 
 
 
266 aa  132  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.04962  normal  0.390443 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3464  hypothetical protein  33.83 
 
 
248 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.616486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1543  hypothetical protein  32.96 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0856493  normal  0.144706 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2488  hypothetical protein  33.45 
 
 
259 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.378044 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0645  hypothetical protein  31.82 
 
 
256 aa  112  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.420731  normal  0.281398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5887  hypothetical protein  35.77 
 
 
249 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  0.859333 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2882  hypothetical protein  28.82 
 
 
293 aa  98.6  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0878  hypothetical protein  26.77 
 
 
242 aa  80.1  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312149 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0308  hypothetical protein  32.79 
 
 
264 aa  71.2  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0633  hypothetical protein  32.21 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>