25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4612 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4612  terpene synthase, metal-binding  100 
 
 		 393 aa  785    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000213288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2620  hypothetical protein  43.85 
 
 		 448 aa  235  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0236435  hitchhiker  0.00226971 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1841  Terpene synthase, metal-binding  38.71 
 
 		 335 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1991  terpene synthase metal-binding protein  40.94 
 
 		 373 aa  220  3e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.81595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4614  hypothetical protein  28.96 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000226989 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2987  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.3 
 
 		 338 aa  76.3  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0493  Terpene synthase, metal-binding protein  29.22 
 
 		 324 aa  72  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3509  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.88 
 
 		 326 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4100  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.01 
 
 		 325 aa  63.2  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.421743  hitchhiker  0.00192352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4730  Terpene synthase metal-binding domain protein  26.88 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0913781  decreased coverage  0.0000445956 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0622  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.04 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0581453 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6866  hypothetical protein  28.57 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.626289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0075  putative terpene cyclase  25.37 
 
 		 745 aa  61.6  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1797  Terpene synthase metal-binding domain protein  22.22 
 
 		 344 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.483748  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0977  Terpene synthase metal-binding domain protein  24.73 
 
 		 751 aa  55.1  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2648  hypothetical protein  26.52 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2716  hypothetical protein  26.32 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1982  Terpene synthase, metal-binding  21.85 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150078  normal  0.785629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1127  Terpene synthase metal-binding domain-containing protein  26.32 
 
 		 769 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0393162 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3949  Terpene synthase metal-binding domain protein  27.78 
 
 		 327 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.598954  normal  0.405526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6200  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.07 
 
 		 755 aa  47  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.207338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2988  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  27.56 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5559  terpene synthase metal-binding domain-containing protein  24.37 
 
 		 750 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4231  Terpene synthase, metal-binding  28.57 
 
 		 751 aa  43.9  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1257  Terpene synthase metal-binding domain protein  25.15 
 
 		 756 aa  43.1  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>