26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4376 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_4376  hypothetical protein  100 
 
 
150 aa  286  8e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0601  hypothetical protein  68.7 
 
 
145 aa  159  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0448  hypothetical protein  65.62 
 
 
139 aa  148  3e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.933593  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6170  hypothetical protein  68.75 
 
 
139 aa  145  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.1646 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0459  hypothetical protein  62.88 
 
 
136 aa  136  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.358018  normal  0.315818 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37700  hypothetical protein  61.15 
 
 
146 aa  133  8e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.251793 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4231  hypothetical protein  60.61 
 
 
161 aa  127  6e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.13795  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5100  hypothetical protein  53.69 
 
 
153 aa  122  2e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0901  hypothetical protein  60 
 
 
132 aa  112  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6827  hypothetical protein  57.03 
 
 
144 aa  110  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4911  hypothetical protein  51.68 
 
 
156 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4528  hypothetical protein  51.68 
 
 
156 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4615  hypothetical protein  51.68 
 
 
156 aa  104  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1647  hypothetical protein  52.7 
 
 
153 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0162474  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18690  hypothetical protein  55.63 
 
 
161 aa  93.6  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2109  hypothetical protein  55.71 
 
 
148 aa  77  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141292  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3031  hypothetical protein  48.94 
 
 
161 aa  68.9  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4580  hypothetical protein  31.88 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00353723  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0177  hypothetical protein  33.83 
 
 
148 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00894063  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5222  glutaredoxin/malate transporter fusion protein  39.45 
 
 
172 aa  57.4  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275883  normal  0.897552 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2285  hypothetical protein  32.31 
 
 
177 aa  57  0.00000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.158037  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4354  hypothetical protein  35.35 
 
 
174 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.909208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1574  hypothetical protein  38.32 
 
 
166 aa  54.3  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0151  CDP-alcohol phosphatidyltransferase  34.92 
 
 
142 aa  48.9  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000000000978734  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2309  hypothetical protein  36.11 
 
 
158 aa  48.5  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000360687 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2442  hypothetical protein  36 
 
 
172 aa  43.9  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.518051  normal  0.130752 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>