16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_4186 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_4186  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 		 421 aa  801    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0605238  normal  0.40114 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4647  hypothetical protein  62.53 
 
 		 441 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.394865  normal  0.107362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4592  major facilitator superfamily MFS_1  28.71 
 
 		 408 aa  80.1  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3099  major facilitator transporter  25.51 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4618  major facilitator superfamily MFS_1  28.28 
 
 		 412 aa  68.9  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1256  major facilitator superfamily protein  27.32 
 
 		 407 aa  67.4  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal  0.0983357 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3674  major facilitator superfamily MFS_1  26.63 
 
 		 452 aa  54.3  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.878146  normal  0.946449 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3507  major facilitator transporter  26.89 
 
 		 398 aa  53.9  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4649  major facilitator superfamily MFS_1  26.69 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.788298  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_880  major facilitator family transporter  31.25 
 
 		 423 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0896  major facilitator transporter  30.47 
 
 		 395 aa  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1065  major facilitator superfamily MFS_1  28.52 
 
 		 404 aa  45.8  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137002  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1490  major facilitator transporter  30.05 
 
 		 398 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.613246 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0189  major facilitator superfamily MFS_1  26.01 
 
 		 415 aa  43.9  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4170  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4282  major facilitator superfamily MFS_1  26.32 
 
 		 420 aa  43.5  0.007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.522642 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>