16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1251 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1251  Apolipoprotein A1/A4/E  100 
 
 
1197 aa  2286    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0139  putative cell division initiation protein  38 
 
 
452 aa  93.2  3e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00239909  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1609  hypothetical protein  29.44 
 
 
684 aa  88.2  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.173558 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1117  DivIVA domain protein  43.64 
 
 
442 aa  79  0.0000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.378079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1330  hypothetical protein  30.33 
 
 
619 aa  69.7  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3614  hypothetical protein  27.17 
 
 
809 aa  61.6  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.765389 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3894  hypothetical protein  30.41 
 
 
441 aa  60.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4115  hypothetical protein  35.5 
 
 
420 aa  53.5  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2763  hypothetical protein  30.95 
 
 
497 aa  51.2  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.649804  hitchhiker  0.000815548 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4982  hypothetical protein  22.67 
 
 
2665 aa  50.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.425549 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28570  hypothetical protein  28.07 
 
 
395 aa  49.7  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.189802 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6106  hypothetical protein  30.99 
 
 
435 aa  49.3  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1695  hypothetical protein  28.92 
 
 
428 aa  48.9  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0823128  normal  0.166853 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12942  hypothetical protein  29.03 
 
 
245 aa  48.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1089  hypothetical protein  27.29 
 
 
753 aa  47.4  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.720305  normal  0.873854 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2169  hypothetical protein  32.24 
 
 
245 aa  45.4  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.545168  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>