23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1049 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1049  hypothetical protein  100 
 
 
378 aa  749    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103501  normal  0.689051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0937  hypothetical protein  31.67 
 
 
376 aa  79.3  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126453  normal  0.615461 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4930  hypothetical protein  32.11 
 
 
396 aa  70.9  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4634  hypothetical protein  27.06 
 
 
381 aa  66.2  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2091  hypothetical protein  27.98 
 
 
376 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0133003  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7624  hypothetical protein  27.46 
 
 
409 aa  63.5  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.130865 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5392  hypothetical protein  27.57 
 
 
385 aa  63.2  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1310  hypothetical protein  28.87 
 
 
382 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.186399  normal  0.248493 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4694  hypothetical protein  26.32 
 
 
351 aa  58.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2703  hypothetical protein  30.52 
 
 
376 aa  54.7  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0453731  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2051  hypothetical protein  24.19 
 
 
460 aa  53.5  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.492002  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1944  hypothetical protein  26.29 
 
 
360 aa  52.8  0.000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.99861  normal  0.710657 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2802  hypothetical protein  24.09 
 
 
841 aa  52.4  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0370  cysteine-rich repeat protein  27.09 
 
 
744 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.4945 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0670  hypothetical protein  27.47 
 
 
1024 aa  49.7  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.680595  normal  0.165032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0693  hypothetical protein  31.1 
 
 
369 aa  48.9  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1207  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.62 
 
 
616 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3425  BNR repeat-containing glycosyl hydrolase  27.31 
 
 
352 aa  48.1  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000735114  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5301  cysteine-rich repeat protein  24.13 
 
 
794 aa  45.4  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2786  hypothetical protein  27.04 
 
 
740 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0459  hypothetical protein  23.83 
 
 
363 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00104382 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1427  hypothetical protein  23.44 
 
 
303 aa  44.3  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.549481  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  32.63 
 
 
283 aa  43.1  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>