32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3278 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_3278  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  182  1.0000000000000001e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1608  glutaredoxin 2  37.93 
 
 		 79 aa  55.1  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0645835  normal  0.325879 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2469  glutaredoxin 2  37.65 
 
 		 78 aa  54.3  0.0000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000139759  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1602  glutaredoxin 2  37.93 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0453519  normal  0.809084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1633  glutaredoxin 2  36.47 
 
 		 87 aa  51.2  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.127795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19000  hypothetical protein  35.8 
 
 		 85 aa  50.4  0.000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.501632  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02336  hypothetical protein  36.47 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1813  glutaredoxin 2  34.48 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0211689  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1544  hypothetical protein  34.52 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1649  glutaredoxin 2  38.64 
 
 		 79 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.287262  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2660  glutaredoxin 2  36.05 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1741  glutaredoxin 2  34.94 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1552  putative glutaredoxin  36.05 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.240311  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24850  hypothetical protein  34.52 
 
 		 92 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2107  glutaredoxin 2  34.09 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0244786 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1541  glutaredoxin 2  35.63 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3632  glutaredoxin 2  34.09 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1626  glutaredoxin 2  34.09 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.119458 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2498  glutaredoxin 2  35.06 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2282  glutaredoxin 2  35.37 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.316661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2144  glutaredoxin 2  38.16 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.462224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0111  glutaredoxin 2  36.78 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0216  glutaredoxin 2  36.47 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1852  hypothetical protein  35.63 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1601  hypothetical protein  39.08 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.205693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1581  glutaredoxin 2  30 
 
 		 80 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00969683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3966  glutaredoxin 2  33.73 
 
 		 78 aa  41.6  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1094  hypothetical protein  32.94 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.320355  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2609  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000260144  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1775  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.36125  hitchhiker  0.000071758 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2569  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0621222  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2684  glutaredoxin 2  31.76 
 
 		 84 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0116749  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>