19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2923 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2923  polysaccharide deacetylase family protein  100 
 
 		 266 aa  556  1e-157  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.101351  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0659  polysaccharide deacetylase  21.01 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0665283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0678  polysaccharide deacetylase  27.76 
 
 		 322 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3050  polysaccharide deacetylase  22.97 
 
 		 282 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0264951  hitchhiker  0.00155043 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2375  polysaccharide deacetylase  22.74 
 
 		 344 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0310  putative polysaccharide deacetylase  23.48 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.341957 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3770  polysaccharide deacetylase  22.48 
 
 		 274 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1557  polysaccharide deacetylase  25.27 
 
 		 322 aa  49.3  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.367828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2932  polysaccharide deacetylase  24.1 
 
 		 309 aa  47.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.44477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0148  polysaccharide deacetylase  23.98 
 
 		 342 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.577134 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0301  polysaccharide deacetylase  24.89 
 
 		 353 aa  45.4  0.0009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351436  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0440  polysaccharide deacetylase  26.61 
 
 		 283 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.522067  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7657  putative polysaccharide deacetylase  33.33 
 
 		 274 aa  44.3  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3984  polysaccharide deacetylase  26.88 
 
 		 322 aa  44.3  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1971  putative xylanase/chitin deacetylase  28.99 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0644502  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1905  polysaccharide deacetylase  28.99 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371349  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0040  polysaccharide deacetylase  27.27 
 
 		 258 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000142029 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5022  polysaccharide deacetylase family protein  24.52 
 
 		 327 aa  42.4  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0134312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3589  polysaccharide deacetylase  36.62 
 
 		 264 aa  42  0.009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.525818  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>