36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1470 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  100 
 
 		 155 aa  322  2e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  55.15 
 
 		 155 aa  167  4e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  50.68 
 
 		 161 aa  160  5.0000000000000005e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1323  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1315  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  159  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.423313 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1253  hypothetical protein  50.34 
 
 		 149 aa  158  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2603  hypothetical protein  47.33 
 
 		 149 aa  156  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109268  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3256  hypothetical protein  48.32 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3106  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3093  hypothetical protein  49.66 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1410  protein of unknown function DUF400  47.65 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  53.08 
 
 		 148 aa  155  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2968  hypothetical protein  47.65 
 
 		 149 aa  154  3e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2953  hypothetical protein  46.98 
 
 		 149 aa  153  7e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.933288  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  51.77 
 
 		 148 aa  152  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  48.98 
 
 		 148 aa  152  2e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2324  hypothetical protein  46.48 
 
 		 151 aa  148  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.498229  normal  0.209106 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  51.54 
 
 		 148 aa  148  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  51.54 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1798  putative lipoprotein  40.48 
 
 		 145 aa  95.1  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  45.05 
 
 		 144 aa  94.7  5e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  46.24 
 
 		 143 aa  86.7  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  45.16 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1665  hypothetical protein  37.96 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0187623  normal  0.0199071 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0035  hypothetical protein  37.04 
 
 		 133 aa  75.5  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.418457  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1619  hypothetical protein  33.02 
 
 		 106 aa  65.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.321765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  35.8 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  27.63 
 
 		 209 aa  50.4  0.000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  26.14 
 
 		 178 aa  48.9  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 171 aa  48.5  0.00003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  30.34 
 
 		 171 aa  48.5  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  25.84 
 
 		 166 aa  47.4  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  29.21 
 
 		 172 aa  47  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  22.06 
 
 		 145 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  23.85 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>