46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0071 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0071  hemY protein  100 
 
 		 403 aa  822    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2401  hemY protein  24.32 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0339  HemY-like  22.94 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00317  heme biosynthesis protein  21.78 
 
 		 393 aa  78.2  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3983  putative protoheme IX biogenesis protein  24.24 
 
 		 399 aa  77.4  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4174  putative protoheme IX biogenesis protein  23.97 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.123419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0225  putative protoheme IX biogenesis protein  24.74 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002103  HemY-like protein  21.2 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4205  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0124972  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4177  HemY protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.849055  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03626  hypothetical protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.274284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5240  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4261  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4167  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.130048  normal  0.307244 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4317  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00516083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4022  putative protoheme IX biogenesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000011562  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03677  predicted protoheme IX synthesis protein  23.94 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.28898  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00147  uncharacterized enzyme of heme biosynthesis  22.13 
 
 		 391 aa  71.6  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4019  putative protoheme IX biogenesis protein  24.64 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124831  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0315  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 388 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0176  putative protoheme IX biogenesis protein  23.56 
 
 		 398 aa  71.2  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.109519  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0195  putative protoheme IX biogenesis protein  24.64 
 
 		 406 aa  71.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107641  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0533  putative protoheme IX biogenesis protein  24.64 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0175  putative protoheme IX biogenesis protein  25.35 
 
 		 398 aa  64.3  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00876626  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3990  putative protoheme IX biogenesis protein  21.82 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00160322  normal  0.165471 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0370  HemY domain-containing protein  23.75 
 
 		 389 aa  60.1  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4148  putative protoheme IX biogenesis protein  22.38 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0333333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4217  putative protoheme IX biogenesis protein  22.38 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0192261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4324  putative protoheme IX biogenesis protein  22.38 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00653056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4163  putative protoheme IX biogenesis protein  22.1 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000026961  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0217  protein HemY  22.36 
 
 		 393 aa  56.2  0.0000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4265  putative protoheme IX biogenesis protein  22.1 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00998904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0437  HemY domain-containing protein  23.46 
 
 		 389 aa  54.3  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0480  HemY domain-containing protein  25 
 
 		 389 aa  53.9  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0385  HemY-like protein  23.12 
 
 		 396 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.639304  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0047  porphyrin biosynthesis protein  20.52 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4003  HemY domain-containing protein  24.33 
 
 		 388 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0287535  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3639  HemY domain-containing protein  23.2 
 
 		 396 aa  51.6  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.510419  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4316  hemY protein, putative  22.52 
 
 		 388 aa  49.3  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2794  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  21.72 
 
 		 395 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3904  HemY domain protein  23.53 
 
 		 388 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2663  protoporphyrinogen IX and coproporphyrinogen III oxidase HemY  22.16 
 
 		 395 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3981  HemY domain-containing protein  23.26 
 
 		 388 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1028  HemY domain-containing protein  23.37 
 
 		 441 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.791332  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3641  HemY domain-containing protein  22.79 
 
 		 388 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3664  metal dependent phosphohydrolase  21.2 
 
 		 403 aa  44.3  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.421403 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>