More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_2434 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  68.17 
 
 
466 aa  662    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  98.76 
 
 
482 aa  973    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
482 aa  983    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1098  Aldehyde Dehydrogenase  57.59 
 
 
476 aa  565  1e-160  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0940  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.49 
 
 
479 aa  556  1e-157  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1032  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.7 
 
 
479 aa  555  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000846624  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4521  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.51 
 
 
477 aa  552  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0808  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.07 
 
 
479 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000282988  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0756  aldehyde dehydrogenase  54.07 
 
 
479 aa  551  1e-156  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000284676  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0757  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  54.28 
 
 
479 aa  553  1e-156  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0750  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (NADP+)  54.49 
 
 
479 aa  555  1e-156  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00148765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0944  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.28 
 
 
479 aa  554  1e-156  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0585208 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0905  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.07 
 
 
479 aa  551  1e-156  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000826884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0849  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  54.07 
 
 
479 aa  551  1e-156  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0684  aldehyde dehydrogenase  53.65 
 
 
479 aa  549  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4434  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  53.86 
 
 
479 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000799989  normal  0.104038 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0800  Aldehyde Dehydrogenase  55.6 
 
 
457 aa  528  1e-149  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1241  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  54.85 
 
 
477 aa  530  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0823  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  52.08 
 
 
475 aa  521  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00319051  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0461  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  49.36 
 
 
471 aa  453  1.0000000000000001e-126  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12614  predicted protein  48.65 
 
 
482 aa  437  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.410099  normal  0.074058 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl259  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  46.35 
 
 
472 aa  420  1e-116  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000056428  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0371  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  40.84 
 
 
475 aa  351  2e-95  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  39.74 
 
 
479 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  39.78 
 
 
464 aa  347  4e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  39.91 
 
 
475 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  38.61 
 
 
484 aa  340  2.9999999999999998e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  37.74 
 
 
477 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
465 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  36.36 
 
 
475 aa  323  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  35.94 
 
 
475 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  37.92 
 
 
494 aa  320  3e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0829  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
503 aa  320  3.9999999999999996e-86  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0391046  unclonable  0.0000197255 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0560  Aldehyde Dehydrogenase  37.23 
 
 
500 aa  318  1e-85  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1702  Aldehyde Dehydrogenase  37.82 
 
 
498 aa  318  1e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1222  aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
497 aa  317  3e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1554  aldehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
498 aa  315  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.220201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  38.22 
 
 
480 aa  315  9.999999999999999e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2131  aldehyde dehydrogenase  36.58 
 
 
480 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1253  Aldehyde Dehydrogenase  38.7 
 
 
493 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2387  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  37.86 
 
 
493 aa  311  1e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.957539  normal  0.715084 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2213  Aldehyde Dehydrogenase  37.09 
 
 
499 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273985 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  36.32 
 
 
484 aa  310  4e-83  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
468 aa  310  4e-83  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0316  Aldehyde Dehydrogenase  38.1 
 
 
496 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  36.61 
 
 
510 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1976  succinate semialdehyde dehydrogenase  38.54 
 
 
496 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.275824  normal  0.526034 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1459  aldehyde dehydrogenase  37.28 
 
 
505 aa  307  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  37.09 
 
 
474 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  34.38 
 
 
477 aa  306  4.0000000000000004e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1119  aldehyde dehydrogenase  36.91 
 
 
478 aa  306  7e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.193972  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  37.31 
 
 
474 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.09 
 
 
482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  37.53 
 
 
474 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0383  Aldehyde Dehydrogenase  39.35 
 
 
493 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  38.34 
 
 
465 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  37.31 
 
 
474 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  37.31 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  37.31 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  37.31 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1691  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.63 
 
 
484 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.943711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.62 
 
 
483 aa  301  1e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.67 
 
 
482 aa  301  1e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
486 aa  302  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.78 
 
 
482 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.78 
 
 
482 aa  301  2e-80  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.78 
 
 
482 aa  301  2e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.78 
 
 
482 aa  301  2e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  36.87 
 
 
474 aa  300  3e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.67 
 
 
482 aa  300  4e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4662  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
493 aa  300  4e-80  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.56 
 
 
482 aa  300  4e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  36.64 
 
 
474 aa  300  5e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  36.21 
 
 
477 aa  299  6e-80  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.67 
 
 
482 aa  299  7e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.34 
 
 
482 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.34 
 
 
482 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.34 
 
 
482 aa  299  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.99 
 
 
482 aa  298  1e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1015  aldehyde dehydrogenase  35.47 
 
 
496 aa  297  3e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1303  Aldehyde Dehydrogenase  37.2 
 
 
516 aa  296  5e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4351  aldehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
491 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2402  succinic semialdehyde dehydrogenase  38.92 
 
 
490 aa  296  7e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.341651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.36 
 
 
480 aa  295  8e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.15 
 
 
480 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1350  putative aldehyde dehydrogenase  35.56 
 
 
496 aa  295  1e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  36.74 
 
 
487 aa  295  1e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1018  Aldehyde Dehydrogenase  36.44 
 
 
510 aa  295  1e-78  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  35.09 
 
 
472 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1496  NAD-dependent aldehyde dehydrogenases  34.06 
 
 
496 aa  295  2e-78  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000254816  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0912  Aldehyde Dehydrogenase  35.55 
 
 
483 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.93 
 
 
480 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  35.98 
 
 
474 aa  293  3e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3191  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.08 
 
 
483 aa  293  4e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  35 
 
 
473 aa  293  4e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
465 aa  293  5e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.93 
 
 
480 aa  293  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
465 aa  293  6e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.8 
 
 
480 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  37.47 
 
 
465 aa  292  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>