More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0665 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0665  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent,putative  100 
 
 		 472 aa  955    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4960  Aldehyde Dehydrogenase  65.6 
 
 		 469 aa  641    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.613851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0699  aldehyde dehydrogenase  98.52 
 
 		 472 aa  941    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0351901  hitchhiker  0.00852309 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5062  Aldehyde Dehydrogenase  66.24 
 
 		 473 aa  646    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.338258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3561  aldehyde dehydrogenase  63.34 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4843  aldehyde dehydrogenase  62.47 
 
 		 476 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840357  normal  0.214894 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6798  aldehyde dehydrogenase  60.49 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.271512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4288  aldehyde dehydrogenase  62.25 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0354203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0484  Aldehyde Dehydrogenase  41.58 
 
 		 464 aa  410  1e-113  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1578  aldehyde dehydrogenase  43.39 
 
 		 475 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000814705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1309  aldehyde dehydrogenase  44.03 
 
 		 477 aa  370  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.472659  normal  0.0179284 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1108  aldehyde dehydrogenase family protein  42.29 
 
 		 475 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00189493  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1493  Aldehyde Dehydrogenase  41.43 
 
 		 477 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0589665  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1421  aldehyde dehydrogenase  42.42 
 
 		 490 aa  351  2e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.545693  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8568  Aldehyde Dehydrogenase  43.78 
 
 		 484 aa  349  6e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1075  Aldehyde Dehydrogenase  40.13 
 
 		 475 aa  348  2e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0544  Aldehyde Dehydrogenase_  38.06 
 
 		 477 aa  345  8.999999999999999e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.257528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0559  aldehyde dehydrogenase  42.29 
 
 		 473 aa  343  5.999999999999999e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.088227  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1487  Aldehyde Dehydrogenase  38.83 
 
 		 479 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2498  putative aldehyde dehydrogenase  41.28 
 
 		 470 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1239  Aldehyde Dehydrogenase  37.77 
 
 		 494 aa  336  5e-91  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2752  Aldehyde Dehydrogenase  41.63 
 
 		 475 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0764  aldehyde dehydrogenase  38.85 
 
 		 484 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0468  aldehyde dehydrogenase  37.75 
 
 		 472 aa  333  5e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2500  aldehyde dehydrogenase  43.36 
 
 		 475 aa  332  6e-90  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1531  aldehyde dehydrogenase  38.63 
 
 		 481 aa  326  6e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2271  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 474 aa  324  3e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2073  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  38.24 
 
 		 474 aa  323  6e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.578512  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2135  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 474 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.806044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2289  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 474 aa  322  8e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.896409  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2314  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 474 aa  322  8e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2069  succinic-semialdehyde dehydrogenase NAD(P)+  38.24 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3054  aldehyde dehydrogenase family protein  38.24 
 
 		 474 aa  322  9.999999999999999e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2108  aldehyde dehydrogenase  37.58 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2398  aldehyde dehydrogenase family protein  38.02 
 
 		 474 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2323  aldehyde dehydrogenase family protein  37.8 
 
 		 474 aa  319  7e-86  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.489166  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1037  aldehyde dehydrogenase  41.46 
 
 		 481 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.030007 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1030  aldehyde dehydrogenase  35.73 
 
 		 465 aa  312  1e-83  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3490  aldehyde dehydrogenase  40.76 
 
 		 477 aa  308  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1360  Aldehyde Dehydrogenase  42.86 
 
 		 482 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.751773  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0090  aldehyde dehydrogenase  35.22 
 
 		 465 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4339  Aldehyde Dehydrogenase  41.56 
 
 		 482 aa  306  5.0000000000000004e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.222249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1187  aldehyde dehydrogenase  35.65 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0731  aldehyde dehydrogenase  35.43 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.774486  normal  0.292001 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1899  aldehyde dehydrogenase  36.44 
 
 		 471 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0796  aldehyde dehydrogenase  34.57 
 
 		 465 aa  301  1e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3072  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 483 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000000976863  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1869  putative NADP-dependentglyceraldehyde-3- phosphate dehydrogenase  38.61 
 
 		 483 aa  301  2e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000063201  normal  0.209762 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5295  aldehyde dehydrogenase  39.13 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000000061233  decreased coverage  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3133  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.34 
 
 		 484 aa  301  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000500159 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3157  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0316898 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3141  aldehyde dehydrogenase  37.12 
 
 		 484 aa  300  5e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2083  aldehyde dehydrogenase  35.75 
 
 		 478 aa  299  6e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774453  normal  0.0850344 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3721  aldehyde dehydrogenase  38.82 
 
 		 487 aa  299  7e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.262273  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6492  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00244112  normal  0.443182 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1988  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 484 aa  299  7e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4691  aldehyde dehydrogenase  37.61 
 
 		 486 aa  299  7e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4656  aldehyde dehydrogenase  39.05 
 
 		 484 aa  299  8e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  unclonable  0.0000000188591  normal  0.0270817 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4973  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 484 aa  299  9e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000556305  normal  0.433203 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0744  aldehyde dehydrogenase (NAD+)  39.51 
 
 		 496 aa  298  2e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0497509  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3193  aldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 484 aa  298  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4512  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.42 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  0.628578 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5184  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  38.83 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000798563  normal  0.630733 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5877  aldehyde dehydrogenase  38.73 
 
 		 480 aa  297  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0353  aldehyde dehydrogenase  38.7 
 
 		 484 aa  297  3e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000407244  normal  0.855721 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0611  aldehyde dehydrogenase  39.2 
 
 		 478 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.25734  normal  0.381542 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00657  Aldehyde dehydrogenase  36 
 
 		 475 aa  296  4e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3825  aldehyde dehydrogenase  41 
 
 		 480 aa  296  5e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.344076  normal  0.0683109 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2528  aldehyde dehydrogenase  36.9 
 
 		 484 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2748  glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, NADP-dependent  35.09 
 
 		 482 aa  296  6e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3076  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  37.2 
 
 		 484 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.20557 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2170  aldehyde dehydrogenase family protein  39.15 
 
 		 517 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.212122  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5291  Aldehyde Dehydrogenase  36.61 
 
 		 475 aa  295  2e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2434  NADP-dependent glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase  35.09 
 
 		 482 aa  295  2e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0907  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.15 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.140416  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0815  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  39.15 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.402156  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0868  Aldehyde Dehydrogenase  36.82 
 
 		 484 aa  294  2e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0073  aldehyde dehydrogenase  35.56 
 
 		 468 aa  293  3e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2418  aldehyde dehydrogenase  33.63 
 
 		 466 aa  293  5e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000897438  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0762  aldehyde dehydrogenase  35.49 
 
 		 475 aa  293  7e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.338463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4795  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  38.18 
 
 		 483 aa  292  9e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000133689  hitchhiker  0.00000131204 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3740  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 		 477 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.485189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3952  Aldehyde Dehydrogenase  39.91 
 
 		 488 aa  291  1e-77  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.73153  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1959  putative succinate-semialdehyde dehydrogenase  40.13 
 
 		 473 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.195174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6531  aldehyde dehydrogenase  36.73 
 
 		 481 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0162128  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5510  aldehyde dehydrogenase  35.84 
 
 		 477 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4580  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.204426  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7826  Aldehyde Dehydrogenase  39.25 
 
 		 481 aa  290  4e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3783  aldehyde dehydrogenase  37.11 
 
 		 477 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.152056  normal  0.465588 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4949  aldehyde dehydrogenase  37.35 
 
 		 477 aa  289  6e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6228  phosphonoacetaldehyde dehydrogenase  38.05 
 
 		 485 aa  290  6e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0227  aldehyde dehydrogenase  37.17 
 
 		 478 aa  289  9e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1774  aldehyde dehydrogenase  37.5 
 
 		 480 aa  288  1e-76  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.00658035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0829  aldehyde dehydrogenase  34.04 
 
 		 473 aa  288  1e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0312676  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2695  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.8 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1391  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0213  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2549  aldehyde dehydrogenase (NAD) family protein  37.8 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.617873  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2378  aldehyde dehydrogenase  36.34 
 
 		 478 aa  288  2e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1588  aldehyde dehydrogenase  37.8 
 
 		 477 aa  288  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>